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barseqtools:我用来分析 bar-seq 数据的代码
共28个文件
py:19个
tsv:3个
readme-lsu-experiments:1个
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2021-06-13
13:55:50
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工具栏 我正在编写用于分析 bar-seq 数据的代码(尽管它可能有一些用处,但基本上未完成)。 这个 repo 包含我正在开发的 python 代码,用于处理一些由拉斐尔罗斯比在 LSU 生成的试验酵母 bar-seq 数据。 我已经停止开发这段代码——这个 repo 现在已经死了。 有用的评论即将推出...
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barseqtools-master.zip (28个子文件)
barseqtools-master
docs
README-LSU-experiments 336B
barseqtools
useful_functions.py 23KB
count_universal_primer_bits.py 2KB
barcodediff.py 8KB
classes.py 14KB
sequences.py 2KB
kmerplot.py 4KB
count_sample_indexes.py 4KB
count_yeast_barcodes.py 6KB
index_barcodes.py 1KB
pilot.py 207B
kmer.py 3KB
__init__.py 68B
barseqtools_main.py 28KB
fitting_aln.py 4KB
scripts
barseqtools 121B
barseqtools.bat 100B
__init__.py 0B
barseqtools-script.py 202B
version.py 21B
kmerdiff.py 9KB
data
primers_formatted.tsv 2KB
barseq.sample.fq 4.82MB
primers.tsv 2KB
uptags.tsv 147KB
requirements.txt 62B
setup.py 1KB
README.md 358B
共 28 条
- 1
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