563-final-project

Phylo-Class 563的最终项目 （最新更新2021-04-09） 项目总结 在此项目中，我模拟了在各种参数范围（变异率，物种树分支长度，重组率等）下进行基因座内部重组的遗传数据，以便评估汇总合并方法对于违反“无基因座内部重组”假设的鲁棒性。 有关我的项目和可复制脚本的草稿概述，请参见 。 有关所使用脚本的更多信息，请参见。 去做 完成实施突变。 为此，您应该清楚地考虑管道的外观。 哪些输出应另存为文件？ 实施* BEAST 合并“ execute-”脚本文件。 也许可以这样做，而不是为jc序列编写一个额外的“ execute-”文件。 在Simulation.sh中添加4个字母序列的功能 编写可复制的内容，以便根据模拟数据绘制图。 扩展绘图功能并消除文件名皱纹。 改善文档。 删除脚本文件中过时的注释。 在Simulation-parameters.lisp中归纳重