isiKnock:信号通路的计算机敲除-开源

信号通路是复杂且相互交织的过程。 生物系统的扰动可以揭示通路成分之间复杂的相互作用和依赖性。 isiKnock是一款软件，可自动进行信号通路的计算机敲除并可视化（Hannig等，2019）。 isiKnock基于稳态下信号流的计算来预测敲除行为。 对于计算机敲除概念的解释，请参考Scheidel等。 2016年和Amstein等人。 2017.汉尼格（Hannig）等。 （2019）isiKnock：信号通路中的计算机敲除，Bioinformatics，35（5），892–894 Amstein等。 （2017）海牛不变量揭示了信号网络中的功能途径。 BMC系统生物学，11（1），72。 （2016）沙门氏菌异种捕获的计算机敲除研究。 PLoS计算生物学，12（12），e1005200。