CoGA:R包用于差异共表达分析-开源

CoGA（共表达图分析器）是一个 R 包，用于识别两种表型之间差异共表达的基因集。 该软件从基因表达数据推断基因调控网络，并根据它们的频谱分布比较推断网络的结构特性。 它还在基因中心性、聚类系数和最短路径长度方面比较了网络。 除了差异共表达分析之外，该工具还提供用于网络可视化、根据基因在网络中的“重要性”进行排序以及标准单基因差异表达分析的图形界面。