hollow:Bosco Ho 和 Franz Gruswitz 的 HOLLOW 1.1 的叉子（见 http

Hollow 1.1 (c) 2009. Bosco Ho 和 Franz Gruswitz Hollow 生成假原子，用于识别 PDB 格式中指定的蛋白质结构中的空隙、口袋、通道和凹陷。 有两种有效的模式可以运行该程序：明确推断分子表面的自动模式，以及在预先指定的体积中工作的约束模式。 要查看选项，请在命令行中键入： Python空心.py 该程序需要 Python 2.4 或更高版本。 插图教程请参考网站： 肌红蛋白的内部通路： 。 磷酸盐蛋白的通道表面： 。 # 自动表面检测模式 在自动（也是默认）模式下，在整个蛋白质上构建网格。 要分析大蛋白质，由于生成的网格尺寸较大，请仅使用 1.0 埃或 0.5 埃的粗网格间距。 自动模式需要几个中间计算。 首先计算可及表面积以定义表面原子。 然后我们在所有表面原子上扫过一个大球（比如 8.0 埃）以去除蛋白质表面附