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2020-flexible-targets-snakemake:演示蛇形制作中灵活定位的最小示例
共6个文件
fq:3个
yml:1个
snakefile:1个
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2021-02-21
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2020年-灵活目标-蛇行 运行默认工作流程(工作流程A): snakemake 运行非默认工作流程(工作流程B): snakemake --configfiles test3_config.yml 修改配置文件中的参数以进行混合和匹配! 这是一个很小的蛇文件,每个工作流程只有一个规则,但是,只要每个规则生成的文件名是唯一的(因此,snakemake可以对其进行正确排序),则该模式应适用于任何数量,规则和组合。 如果蛇文件开始变得很大,您可以尝试将它们分成较小的子集,并使用include或subworkflows 。 我倾向于将与单个工具关联的规则保留在较小的snakefile中,然后根据需要包含/排除它们。 在这里,您可以有两个文件ruleA.rule , ruleB.rule ,然后将它们包括/排除在if语句中,在其中我们通过include: "/path/to/ruleA.r
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2020-flexible-targets-snakemake-master.zip (6个子文件)
2020-flexible-targets-snakemake-master
test1.fq 192B
test2.fq 192B
README.md 1018B
Snakefile 1KB
test3.fq 192B
test3_config.yml 47B
共 6 条
- 1
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没名字的女人
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