Pfeature:肽和蛋白质特征的计算

特征：肽和蛋白质特征的计算 介绍 Pfeature是一款全面的软件，可以计算过去几十年来发现的各种蛋白质/肽特征。 它基于以下五个主要模块来计算蛋白质特征： i）组成； ii）二进制配置文件； iii）进化信息； iv）结构和v）模式。 基于组成的模块允许用户进行计算； i）简单的成分，如氨基酸，二肽，三肽； ii）基于理化性质的组合物； iii）氨基酸的重复和分布； iv）香农熵来测量低复杂度区域； iv）杂类成分，如假氨基酸，自相关，三联体，准序列顺序。 氨基酸序列的二进制图谱提供了完整的信息，包括残基的顺序或残基的类型，而这是基于组合物的特征所无法实现的。 因此，二进制图谱可用于在残基水平上注释蛋白质。 在文献中已经很好地确立了，基于进化信息的序列图谱提供了比序列本身更多的信息。 我们已经开发了许多Pfeature的异构体，包括：i）通过通过Web界面使用Pfeature功能的We