GeometricMD:基于毛珀瑞斯原理的分子动力学几何方法。一个并行的Python脚本，用于执行分子动力学计算以解决过渡路径问题。它使用原子模拟环境描述分子系统及其计算器以确定力和势能资源-CSDN文库

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package

GeometricMD-master.zip （30个子文件）

folder

GeometricMD-master

setup.py 608B

.gitignore 906B

LICENSE 7KB

README.md 90B

folder

tests

test_length.py 3KB

__init__.py 28B

folder

test_files

x0.xyz 702B

xN.xyz 702B

full_test.py 1KB

folder

example

butane_single_process.py 368B

x0.xyz 702B

xN.xyz 702B

butane_multi_process.py 419B

folder

docs

Makefile 7KB

make.bat 7KB

folder

source

curve_shorten_pbc.rst 125B

butane_tutorial.rst 2KB

index.rst 1KB

conf.py 11KB

geometry.rst 234B

animation.rst 109B

geometry_pbc.rst 238B

curve_shorten.rst 122B

folder

geometricmd

curve_shorten_pbc.py 13KB

geometry.py 10KB

animation.py 3KB

__init__.py 28B

curve_shorten.py 19KB

geometry_pbc.py 3KB

MANIFEST 164B

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