BioSyn:具有同义词边缘化的生物医学实体表示（Sung等人，ACL 2020）

BioSyn 其中SYN onym边缘化生物医学实体交涉 我们介绍BioSyn用于学习生物医学实体表示。 您可以使用介绍的两个主要组件来训练BioSyn：1）同义词边缘化和2）迭代候选检索。 培训BioSyn后，您可以轻松地将任何生物医学提及标准化或将其表示为实体嵌入。 要求 $ conda create -n BioSyn python=3.6 $ conda activate BioSyn $ conda install numpy tqdm nltk scikit-learn $ conda install pytorch=1.1.0 cudatoolkit=9.0 -c pytorch $ pip install transformers==2.0.0 请注意，必须根据CUDA的版本安装Pytorch。 资源 预训练模型 我们使用的版本，以便可以在pytorch框架上运行预