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clinker:基因簇比较图生成器
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2021-03-04
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熟料 基因簇比较图生成器 它是什么? 熟料是用于轻松生成出版物质量的基因簇比较图的管道。 给定一组GenBank文件,clinker将自动提取蛋白质翻译,在每个簇中的序列之间进行全局比对,根据簇的相似性确定最佳的显示顺序,并生成可进行广泛调整的交互式可视化(使用 )。被导出为SVG文件。 安装 熟料可以通过pip直接安装: pip install clinker 通过从GitHub克隆源代码: git clone https://github.com/gamcil/clinker.git cd clinker pip install . 或者,通过conda: conda create -n clinker -c conda-forge -c bioconda clinker-py conda activate clinker 引文 如果您发现熟料有用,请引用: clink
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MaDaniel
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