paradigm:生成寄生虫基因组规模代谢模型综合数据库的管道

ParaDIGM：寄生虫数据库，包括基因组规模的代谢模型 Carey等人撰写的标题为“比较寄生虫与基因组规模的代谢模型的全面数据库的比较分析”的手稿的代码可用性。 该文章已提交给期刊（DOI：XXX），可在BioRxiv上找到（请参阅此处： ://doi.org/10.1101/772467）。 摘要：原生动物的寄生虫会导致多种疾病，对全球造成巨大影响。 这些生物的发病机理和生物学研究受到经济和实验限制。 因此，经常对一种寄生虫的研究进行推断，以推断出整个属内和属内的另一种寄生虫的知识。 体外或体内模型系统通常用于增强实验可操作性，但通常使用与临床相关病原体相关但又与之相关的物种。 寄生虫物种之间功能差异的表征仅限于事后研究或单一目标研究，从而限制了这种外推方法的实用性。 为了解决这一挑战并广泛地促进寄生虫学研究，我们对192个基因组进行了功能比较分析，代表了每个高质量，公开可用的原