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权重系数确定matlab代码-dotwalkR:dotwalkR
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2021-05-22
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权重系数确定matlab代码DotWalkR-进化模拟 DotWalkR是一种进化模拟,它使用前向Euler“行走”来模拟通过参数空间的生物谱系(点)。 每个尺寸轴表示正交参数。 参数空间中谱系的表现是动物在空间中位置的函数(标量函数)。 每个时间步长( deltaf )中的位置变化由两个元素确定: 对动物施加了方向选择,以迫使它们与渐变交互: k*walktowards*beta[j, ]*delta.t 其中k是选择遗传系数, walktowards指定沿梯度向上或向下移动, beta是点位置处的梯度,而delta.t是时间步长。 随机性是通过将伪随机数乘以 randscale*(1 - A)*M*(1-k)*delta.t 其中randscale是比例因子, A是由Sobol指数确定的矩阵, M是一组伪随机数。 标量函数本身基于输出值的21x21x21矩阵,表示一个向下采样的gPC替代函数。 为了估算每个点位置上标量函数的梯度,DotWalkR使用最近邻搜索函数在输出值矩阵内找到最接近的网格点,然后计算替代值的加权平均值以用于仿真。 DotWalkR的输入数据为: 输入数据:长格
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dotwalkR-master.zip (70个子文件)
dotwalkR-master
data
example-data
clvz
clvz_resampled_surrogate_long.mat 67KB
clvz_resampled_grady_long.mat 68KB
clvz_resampled_gradz_long.mat 68KB
clvz_resampled_input_long.mat 4KB
clvz_resampled_gradx_long.mat 67KB
clvz_SI.mat 227B
Q
Q_resampled_input_long.mat 4KB
Q_SI.mat 232B
Q_resampled_gradz_long.mat 69KB
Q_resampled_gradx_long.mat 65KB
Q_resampled_grady_long.mat 67KB
Q_resampled_surrogate_long.mat 69KB
COT
COT_resampled_grady_long.mat 67KB
COT_resampled_gradz_long.mat 69KB
COT_SI.mat 226B
COT_resampled_input_long.mat 4KB
COT_resampled_gradx_long.mat 68KB
COT_resampled_surrogate_long.mat 68KB
clcdclvz
clcdclvz_resampled_surrogate_long.mat 68KB
clcdclvz_resampled_gradx_long.mat 68KB
clcdclvz_resampled_input_long.mat 4KB
clcdclvz_SI.mat 179B
clcdclvz_resampled_grady_long.mat 69KB
clcdclvz_resampled_gradz_long.mat 68KB
clcd
clcd_resampled_input_long.mat 4KB
clcd_resampled_surrogate_long.mat 68KB
clcd_resampled_gradx_long.mat 68KB
clcd_SI.mat 226B
clcd_resampled_gradz_long.mat 69KB
clcd_resampled_grady_long.mat 69KB
parameter-files
parameters-template 196B
tests
testdata
parameters-testconsty 197B
constz_resampled_input_long.mat 4KB
consty_resampled_gradx_long.mat 223B
consty_resampled_input_long.mat 4KB
constz_resampled_gradz_long.mat 276B
consty_SI.mat 173B
constz_resampled_gradx_long.mat 223B
constx_resampled_input_long.mat 4KB
constz_SI.mat 173B
scaling_resampled_gradx_long.mat 669B
constx_resampled_grady_long.mat 223B
constx_resampled_gradz_long.mat 223B
consty_resampled_surrogate_long.mat 830B
constx_SI.mat 173B
constz_resampled_grady_long.mat 223B
scaling_resampled_gradz_long.mat 223B
scaling_resampled_input_long.mat 4KB
consty_resampled_gradz_long.mat 223B
consty_resampled_grady_long.mat 1KB
scaling_SI.mat 173B
constx_resampled_surrogate_long.mat 2KB
constz_resampled_surrogate_long.mat 883B
parameters-testconstx 197B
scaling_resampled_surrogate_long.mat 2KB
constx_resampled_gradx_long.mat 669B
parameters-testconstz 197B
parameters-scaling 188B
scaling_resampled_grady_long.mat 223B
test_dotwalkr.R 5KB
scaling_study.R 2KB
install_dotwalkr.R 843B
dotwalkR.Rproj 205B
src
functions
plot_functions.R 350B
walkR_functions.R 6KB
init_dotwalk.R 4KB
plotdots.R 1KB
dotwalkr.R 2KB
.gitignore 50B
README.md 9KB
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