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psf的matlab代码-measurePSF:沿不同轴测量PSFFWHM
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2021-05-24
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psf的matlab代码测量PSF 该存储库包含以下旨在与ScanImage一起使用的MATLAB工具。 recordPSF获取PSF堆栈 measurePSF PSF以估计PSF大小。 对于演示,请运行measurePSF('demo') 。 Grid2MicsPerPixel通过分析EM网格的图像来测量每个像素沿x和y的微米数。 mpsf_tools.meanFrame在扫描时将平均帧强度绘制为时间的函数。 安装 将measurePSF code目录添加到您的MATLAB路径。 使用平均和fastZ在ScanImage中获得PSF 为了获得良好的亚微米珠子图像,我通常将其缩放到20倍或25倍,并使用256 x 256像素的图像大小。 我每0.25微米拍摄一次z平面,每个平面平均获得25到40张图像。 不值得做更多的事情,因为我们将为z强度曲线拟合一条曲线。 要测量PSF,您可以使用随附的recordPSF功能,也可以手动设置ScanImage(如果需要,请参阅documentation文件夹)。 使用recordPSF获得PSF 寻找珠子,放大。 仅选择一个频道保存在“频道”窗口中
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measurePSF-master.zip (29个子文件)
measurePSF-master
documentation
EM_Grid_Slide.txt 589B
Manual_ScanImage_zstack.txt 1KB
LICENSE 7KB
code
+mpsf_tools
meanFrame.m 10KB
load3Dtiff.m 4KB
logpath.m 528B
scanImage_stackLoad.m 945B
@measurePSF
plotCrossSectionAndFit.m 2KB
fit_Intensity.m 1KB
measurePSF.m 25KB
setUpFigureWindow.m 5KB
updateXYfits.m 1KB
denoiseImStackAndFindPSFcenterInZ.m 2KB
findPSF_centreInXY.m 830B
+sibridge
silinker.m 1KB
readTifHeader.m 4KB
getCurrentImage.m 911B
getFOV.m 694B
getSIobject.m 944B
setObjectiveResolution.m 1KB
logpath.m 758B
.gitignore 11B
@Grid2MicsPerPixel
buildFigure.m 3KB
findGridAngle.m 2KB
Grid2MicsPerPixel.m 14KB
PSF.mat 951KB
recordPSF.m 5KB
.gitignore 11B
README.md 5KB
共 29 条
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