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论文中matlab代码格式标准化-NWBExamples:探索将数据文件格式化/转换为NWB的存储库
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2021-05-26
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论文中matlab代码格式标准化NWB示例 该存储库是使用NWB文件存储人类单神经元数据的示例和探索。 概述 该格式是用于存储神经生理学数据的标准化文件格式。 该存储库包括一些创建和使用NWB文件的概述示例,以及相关的分析和工具,它们演示了NWB文件的实用性。 仓库布局 该存储库包含按Jupyter笔记本组织的一系列示例。 包括以下笔记本: 01介绍了NWB文件格式的基础 02探索将NWB文件用于人类峰值数据 03探索分析以NWB格式存储的数据 04探索使用NWB文件的组级别分析 05探索存储在NWB文件中的尖峰排序数据 A1探索元数据文件以进行数据转换 请注意,笔记本01、02和05使用模拟数据,而03和04使用下面描述的公开可用的数据集。 要求 该存储库使用Python(> = 3.7)。 该存储库需要以下模块: 其他可选依赖项包括: 穗分选演示 用于元数据文件附录 数据 一些示例使用了公开可用的NWB格式的数据集,其中包含“识别记忆”(RM)任务期间人类患者的单个单位记录。 此版本的数据和相关文件可在以下位置获得 数据: 代码: 。 下表描述了此数据集: 其他资源 相关链接: 网
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NWBExamples-main.zip (17个子文件)
NWBExamples-main
01-NWB_Basics.ipynb 9KB
.gitignore 82B
requirements.txt 34B
data
.gitadd 0B
05-SI-SpikeSorting.ipynb 6KB
metadata
site_info.yaml 34B
subject_info.yaml 200B
test_config.yaml 176B
test_config.cfg 199B
task_info.yaml 219B
test_ini.ini 148B
test_config.json 197B
README.md 3KB
A1-MetadataFiles.ipynb 11KB
04-RM-GroupExploration.ipynb 293KB
02-NWB_SingleNeurons.ipynb 20KB
03-RM-DataExploration.ipynb 1.24MB
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weixin_38741195
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