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matlab喷泉码代码-dna-storage:dna-存储
共265个文件
fastq:6个
z17:4个
z07:4个
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2021-06-12
18:18:25
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matlab喷泉码代码喷泉编码DNA存储系统的协同序列聚类与解码 在这里,存储了用于我的 DNA 存储研究的代码和数据文件。 编码 要编码数据,您可以使用编码器目录中的 LT_code.m。 这是一个 Matlab 文件,我们在本研究中使用了 MATLAB R2019a。 编码策略来自“DNA Fountain 实现了一个强大而高效的存储架构”,Erlich 和 Zielinski,Science 2017。对于 GC-content 和 homopolymer-run 的约束,可以通过固定 Max_run_length、Min_GC_content 和LT_code.m 文件中的 MAX_GC_content。 对于我们的非约束池,我们使用 Max_run_length = 152、Min_GC_content = 0 和 MAX_GC_content = 1。 对于我们的受限池,我们使用 Max_run_length = 3、Min_GC_content = 0.45 和 MAX_GC_content = 0.55。 结果存储在 original_files 目录中。 测序 排序后
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matlab喷泉码代码-dna-storage:dna-存储 (265个子文件)
clustering_example.bat 155B
COPYRIGHT 209B
clustering_stage.cpp 10KB
clustering.exe 53KB
example_con_1.assembled.fastq 24.26MB
example_con_3.assembled.fastq 24.23MB
example_con_2.assembled.fastq 24.18MB
example_ncon_3.assembled.fastq 23.72MB
example_ncon_1.assembled.fastq 23.7MB
example_ncon_2.assembled.fastq 23.69MB
RS_correction_decoding.m 19KB
LT_code.m 9KB
README.md 3KB
image_restart.txt 7.8MB
image_restart.txt 7.8MB
Encoded_oligo_constraint_16050_18000.txt 3.45MB
Encoded_oligo_16050_18000.txt 3.45MB
OP2-2CIF_S1_L001_R2_001.z01 24.41MB
OP1-3CIF_S1_L001_R1_001.z01 24.41MB
OP1-3CIF_S1_L001_R2_001.z01 24.41MB
OP2-2CIF_S1_L001_R1_001.z01 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R1_001.z03 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R2_001.z04 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R2_001.z05 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R1_001.z10 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R2_001.z12 24.41MB
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OP1-3CIF_S1_L001_R2_001.z13 24.41MB
OP1-3CIF_S1_L001_R1_001.z13 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R2_001.z14 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R2_001.z21 24.41MB
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OP2-2CIF_S1_L001_R1_001.z21 24.41MB
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资源评论
- 简甜XIU091610272023-07-26这个文件的代码逻辑清晰,让人更容易理解,同时丝毫不损失实用性,非常棒。
- 三山卡夫卡2023-07-26这个文件用通俗易懂的语言解释了DNA存储中的喷泉码原理,并配备了清晰的代码示例,是入门者的好帮手。
- 曹将2023-07-26这个文件提供了一套简洁而实用的Matlab代码,使得喷泉码的DNA存储变得更加容易理解和实现。
- 石悦2023-07-26这个文件很实用,讲解了如何使用Matlab实现喷泉码的DNA存储,非常有帮助。
- 透明流动虚无2023-07-26通过学习这个文件中的Matlab代码,可以在DNA存储领域中做更多创新的尝试,值得推荐给对该领域感兴趣的人。
weixin_38733676
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