matlab分时代码-PupStruct:PupStruct

matlab分时代码翻译后修饰（PTM）是一种重要的生物学React，可增加蛋白质组的多样化。 由于研究了许多已知的修饰，由于其在调节生物过程中的重要作用，其在科学界越来越受到关注。 传统的检测pupylation位点的实验实践被证明是昂贵的，并且需要大量的时间和资源。 因此，已经开发了许多计算预测器来挑战这个问题，但是，性能仍然受到限制。 在这项研究中，我们提出了另一种称为PupStruct的计算方法，该方法使用氨基酸的结构信息和基于多项式的核函数SVM来预测pupylated赖氨酸残基。 我们将PupStruct与文献中的三个最先进的预测变量进行了比较，其中PupStruct已通过诸如灵敏度（0.8347），特异性（0. 9312），准确性（0.8834），精度（0.9242）的统计指标验证了其性能的显着改善。 ）和基准数据集上的Mathew的相关系数（0.7760）。 您可以使用此代码运行新的pupylation站点预测并将其与您的方法进行比较 脚步： 从此处下载测试数据： 从此处下载代码，并将其放在PupStruct文件夹中 将测试集放在PupStruct文件夹中 打开Matl