JavaScript中的`setTimeout`函数是一个非常基础且常用的异步编程工具，它允许我们在指定的毫秒数后执行一个函数或表达式。然而，在某些特定情况下，比如当遇到`alert`、`prompt`或`confirm`这样的阻塞型浏览器对话框时，`setTimeout`的行为可能会与预期有所不同。
在描述的问题中，当`setTimeout`正在计时的过程中，如果调用了`alert`函数，会出现一个阻塞的对话框。由于JavaScript引擎是单线程的，这意味着在对话框出现时，所有后续的代码执行都会暂停，直到用户关闭这个对话框。因此，`setTimeout`的计时也会被中断，不会继续计时，而是会在对话框关闭后重新开始计时。
例如，假设我们设置了一个`setTimeout`，让它在5分钟后执行某个操作，但在等待3分钟后，弹出了一个`alert`对话框，用户关闭这个对话框后，`setTimeout`不会从之前中断的地方继续计时，而是会从头开始计算剩余的2分钟，所以实际上会等待另外5分钟，总共是8分钟。
这是JavaScript单线程模型的一个特性。在单线程环境中，任何阻塞行为（如`alert`）都会中断事件循环，导致所有异步任务（包括`setTimeout`）的处理暂时停止。这种设计主要是为了保持浏览器的响应性，确保用户界面不会因为后台任务而冻结。一旦阻塞解除，事件循环会继续处理被挂起的任务。
在不同的浏览器窗口或frame中，这一行为是一致的，即使`setTimeout`位于另一个frame内，只要该frame与当前显示`alert`的frame属于同一个浏览器窗口，`alert`仍然会中断所有frame内的`setTimeout`。
对于开发者来说，这种行为可能带来一些挑战，尤其是在需要精确控制时间间隔的场景下。为了解决这个问题，可以考虑使用更高级的异步机制，如Promise或者ES6的`async/await`，以及Web Workers来实现真正的多线程计算。Web Workers允许在后台线程中运行脚本，从而避免了主线程被阻塞的问题。随着HTML5和现代JavaScript的普及，开发者有了更多工具来处理这类复杂情况。
`alert`中断`setTimeout`计时是由于JavaScript的单线程模型和浏览器对话框的阻塞性质决定的。理解这一点有助于开发者避免在编写代码时遇到类似的意外延迟，以及寻找更有效的异步解决方案。
