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matlab的egde源代码-CNMF_E:微内窥镜数据的约束非负矩阵分解
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matlab的egde源代码CNMF_E 微内窥镜数据的约束非负矩阵分解。 “ E”还表示“扩展名”。 它建立在支持1个光子数据的基础之上。 下载 选项1:使用此下载包 选项2 :(推荐)克隆git仓库。 这样,您就可以通过1行命令或1键单击来获取软件包的最新更新。 git clone --recurse-submodules https://github.com/zhoupc/CNMF_E.git 安装 运行cnmfe_setup.m将CNMF-E包添加到MATLAB的搜索路径中 >> cnmfe_setup 所需的MATLAB工具箱在下面列出。 / images / images / shared / optimlib / / signal / signal / / stats / stats / /曲线/曲线 例子 最好的入门方法是运行演示脚本以分析示例数据。 我们提供了三个演示脚本供您尝试。 您可以修改这些演示以处理自己的数据集。 demo_endoscope.m:此演示非常适合对数据进行探索性分析。 它使您对CNMF-E管道的不同阶段以及不同的参数选择如何影响最终结果有很好的
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matlab的egde源代码-CNMF_E:微内窥镜数据的约束非负矩阵分解 (334个子文件)
graph_conn_comp_mex.cpp 3KB
deconvolveCa 12B
.gitignore 297B
.gitmodules 0B
README.html 16KB
analyze_cnmfe_matlab.ipynb 919KB
LICENSE 34KB
versions.log 535B
Sources2D.m 88KB
initComponents_parallel.m 19KB
greedyROI_endoscope.m 18KB
update_temporal_components.m 17KB
update_temporal_components_nb.m 17KB
cont_ca_sampler.m 16KB
initComponents_residual_parallel.m 16KB
smod_bigread2.m 15KB
update_spatial_parallel.m 14KB
deconvolveCa.m 14KB
update_background_parallel.m 13KB
CNMFSetParms.m 12KB
update_temporal_parallel.m 12KB
constrained_foopsi.m 12KB
constrained_foopsi.m 12KB
greedyROI.m 12KB
deconvCa.m 11KB
deconvCa.m 11KB
initTemporal.m 11KB
initComponents_2p.m 11KB
run_cnmfe_matlab.m 10KB
demo_large_data_1p.m 10KB
run_CNMF_patches.m 10KB
demo_sfn_2018.m 9KB
thresholded_oasisAR2.m 9KB
demo_endoscope.m 9KB
greedyROI_corr.m 9KB
cnmfe_background.m 9KB
thresholded_oasisAR1.m 8KB
merge_neurons_dist_corr.m 8KB
constrained_oasisAR1.m 8KB
demo_large_data_2p.m 8KB
merge_close_neighbors.m 8KB
merge_high_corr.m 8KB
constrained_oasisAR2.m 8KB
initComponents_endoscope.m 8KB
initComponents_corr.m 7KB
cnmfe_load.m 7KB
set_parameters.m 7KB
lars_regression_noise.m 7KB
manual_merge_multi_pairs.m 7KB
lars_regression_noise.m 7KB
kde.m 7KB
plot_components_GUI.m 7KB
distribute_data.m 7KB
cnmfe_data.m 7KB
demo_batch_1p.m 7KB
cnmfe_init.m 7KB
viewNeurons.m 6KB
get_next_spikes.m 6KB
demo_batch_2p.m 6KB
plot_continuous_samples.m 6KB
view_components.m 6KB
thresholded_nnls.m 6KB
onnls.m 6KB
merge_components.m 6KB
fig2_demo_deconvolveAR1.m 6KB
foopsi_onnls.m 6KB
foopsi_oasisAR1.m 6KB
cnmfe_neuron.m 6KB
foopsi_oasisAR2.m 5KB
manually_refine_components.m 5KB
initialize_components.m 5KB
update_spatial_components.m 5KB
make_patch_video.m 5KB
preprocess_data.m 5KB
HMC_exact2.m 5KB
show_demixed_video.m 5KB
oasisAR2.m 5KB
displayNeurons.m 5KB
update_spatial_components_nb.m 5KB
foopsi_kernel.m 5KB
bsplineM.m 5KB
determine_search_location.m 5KB
bigread2.m 5KB
MCEM_foopsi.m 5KB
MCEM_foopsi.m 5KB
fig4.m 5KB
local_background.m 5KB
demo_script.m 4KB
update_tau.m 4KB
fig5.m 4KB
running_percentile.m 4KB
get_patch_data.m 4KB
demo_script_class.m 4KB
HALS_temporal.m 4KB
run_movie.m 4KB
quickMerge.m 4KB
oasisAR1.m 4KB
update_kernel_exp2.m 4KB
update_kernel_exp2.m 4KB
MergeNeighbors.m 4KB
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