克隆和生物信息学分析

为了确定TFL1是否与牟平野蔷薇的连续开花表型有关，利用RT-PCR和PCR技术首次从牟平野蔷薇的花芽中克隆了TFL1基因的全长cDNA序列。 RACE方法并命名为RrTFL1。 全长cDNA为973 bp，开放阅读框为519 bp，编码172个氨基酸。 衍生的蛋白质的分子量为19.48 kD，计算的pI为9.13，在1-172位具有c100227保守域，属于PEBP家族。 衍生蛋白是分泌到细胞质中的亲水蛋白。 没有跨膜结构域，也没有信号肽切割位点，五个Ser磷酸化位点，七个Thr磷酸化位点，三个Tyr磷酸化位点，一个O-糖基化位点，和N-糖基化位点。 有24.42％的α-螺旋，36.63％的无规卷曲，27.91％的肽链延伸和11.05％的β-角结构。 来自蔷薇科植物（包括蔷薇）的这种蛋白质和TFL1蛋白质具有87％-96％的序列同源性。 所有蛋白质均包含一个c100227保守结构域，两个高度保守的模块DPDxP，GxHR和两个功能位点His，Asp。 此外，它们的系统发育关系与传统分类是一致的。 这些结果不仅为进一步研究RrTFL1的表达和功能奠定了基础，而且为通过基因工程培育可以连