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SigProfiler:从癌症基因组突变目录中解密突变特征的框架-matlab开发
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2021-05-31
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重要提示:SigProfiler 的 MATLAB 版本将来不会更新或支持。 经过重新设计并且性能更高得多的Python工具SigProfilerExtractor可用于提取突变签名,现在可通过以下网址获得: https : //github.com/AlexandrovLab/SigProfilerExtractor 癌细胞的基因组携带体细胞突变,这是 DNA 损伤和修复过程的累积结果。 到目前为止,还没有描述在癌症基因组中起作用的突变过程特征的理论模型,也没有系统的计算方法可用于破译这些突变特征。 在这里,我们介绍了一个基于 MATLAB 的计算框架,可以有效地解决这些问题。 我们的方法为从癌症衍生的体细胞突变目录中表征突变特征提供了基础,为深入了解所有癌症的共同发病机制铺平了道路。 有关理论模型以及如何使用提供的计算框架的更多信息,请参阅包含的 readme.pdf 文件和支持文
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