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香农代码的matlab-topo-summaries-for-packed-tissues:包装纸的摘要
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2021-05-26
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香农代码的matlab 包装纸巾的拓扑摘要 这是出现在论文“用于分析包装组织中细胞组织的稳定拓扑摘要”中的计算实验。 我们使用TDA来证明二维上皮组织的拓扑几何组织中存在显着差异。 功能必须按以下顺序执行: 遵循文件夹的数字顺序 在每个文件夹中,仅执行按字母顺序以大写字母开头的功能。 需要以下软件: Matlab /八角形 Python [R Jupyter与R内核 工作文件夹必须与执行功能的存储位置相同。 如果您对代码有任何疑问或意见,可以通过电子邮件将其发送给msoriano4。 0_数据/ 文件夹original_data /包含:来自上皮组织的图像(保存在original_data / epithelial_images /中)以及有关CVT路径图像的信息,该图像以.mat文件的形式保存在CVT /中。我们将从上皮图像中获得.mat文件,从CVT中获得png图像。 A_calculate_epithelial_images.m提取上皮图像并将其转换为黑白png文件。 B_calculate_epithelial_data.m从png图像中获取带标签的图像,并使用regionpr
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香农代码的matlab-topo-summaries-for-packed-tissues:包装纸的摘要 (8754个子文件)
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