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利用51个大黄鱼微卫星标记,以一个F1 家系为实验材料,分析了微卫星标记与体长、体高、体质量之间的相关性,发现51 个位点中有9 个位点(LYC0401,LYC0076,LYC0077,LYC0078,KPC43,KPC86,LYC0403,LYC0079,LYC0080)与体长、体高、体质量显著或极显著相关(p<0.05 或p <0.01).其中LYC0401,LYC0076,LYC0078,KPC43,LYC0403和LYC0079的各等位基因与3性状的相关达到显著或极显著水平(p<0.05或p<0.
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第
卷第
期
西 南 大 学 学 报
(
自然科学版
)
年
月
(
)
文章编号
:
(
)
大黄鱼微卫星标记与生长性状的相关分析
叶
华
,
,
刘
洋
,
刘贤德
,
王志勇
集美大学 水产学院 福建省高校水产科学技术与食品安全重点实验室
福建 厦门
西南大学 鱼类繁育与健康养殖研究中心
重庆
摘 要
:
利 用
个 大 黄 鱼 微 卫 星 标 记
,
以 一 个
家 系 为 实 验 材 料
,
分 析 了 微 卫 星 标 记 与 体 长
、
体 高
、
体 质 量 之
间 的 相 关 性
,
发 现
个 位 点 中 有
个 位 点
(
LYC
,
LYC
,
LYC
,
LYC
,
KPC
,
KPC
,
LYC
,
LYC
,
LYC
)
与 体 长
、
体 高
、
体 质 量 显 著 或 极 显 著 相 关
(
p
或
p
)
其 中
LYC
,
LYC
,
LYC
,
KPC
,
LYC
和
LYC
的 各 等 位 基 因 与
性 状 的 相 关 达 到 显 著 或 极 显
著 水 平
(
p
或
p
)
关
键
词
:
大黄鱼
;
微卫星
;
生长性状
;
相关分析
中图分类号
:
Q
959.483
文献标志码
:
A
大黄鱼
Pseudosciaenacrocea
属于鲈形目
石首鱼科
黄鱼属
俗称黄花鱼
黄瓜鱼
黄鱼
是我国海
洋主要经济鱼类之一
也是我国目前养殖量最大的海水 鱼类
微卫星是由 串联的
的简单序列
重复排列
如
或者
组成
微卫星标记因多态性高
含量丰富
共显性遗传及片段
小等优点而成为非常有用的遗传标记
微卫星标记已广泛用于亲子鉴定
遗传多样性分析及遗传连锁图谱
构建中
近几年大黄鱼微卫星标记开发报道较多
目前大黄鱼微卫星标记已经广泛用于群体遗传
结构分析
亲子鉴定
遗传连锁图谱构建等研究中
分析微卫星标记与生长相关性研究在畜禽中报
道较多
在鱼类中仅见鲤鱼
鲫鱼和牙鲆中有 报道
本研究以野 捕驯养原代 雌性大黄鱼 与养殖
雄鱼为亲本杂交的
为材料
分析了
个
位点与体长
体高及体质量之间的相关性
以及不同位点
的基因型与生长相关性状的关联度
为大黄鱼分子育种提供基础资料
1
材料和方法
1.1
实验材料
本研究所用 材料家系构 建于
年
月
用 来 自 不 同 群 体
遗 传 差 异 较 大 的
尾 雄 鱼 和
尾 雌 鱼
为亲本混合 繁殖
构建了一个
混合繁育群 体
在亲鱼产卵 前检查其健 康状况及性 成熟度
并采
用人工催产 措施确保亲 鱼能同步产 卵
亲 鱼 产 卵 结 束 后 剪 取 亲 本 部 分 背 鳍 以
乙 醇 固 定 保 存
同 时
收稿日期
基金项目
国家
计划资助项目
国 家 自然 科学 基 金资 助项 目
集 美 大 学创 新 团 队 科研 基 金 资 助项 目
作者简介
叶
华
女
四川剑阁人
博士
主要从事水产动物遗传育种与生物技术研究
通信作者
王志勇
教授
收集受精卵
于室内孵化 培育
鱼苗全长超 过
后 转 移 至 海 区 网 箱 养 殖
年
月 从 该 群 子 代
月龄
中随机选取
尾
进行表型数 据
体长
体高
体质量
测定
并剪取部分 背鳍固定于
的
乙醇
用于亲子鉴 定分析
根据亲子鉴 定结果选择 野捕驯养原 代雌性大黄 鱼与养殖雄 鱼为亲本的
个
个体家系用 于分析
1.2
微卫星引物
首先用
对微卫星引物对亲本进行扩增
筛选出至少有一个亲本为杂合的引物用于子代的基因型与
全体长
体高和体质量的相关分析
对引物中
对来自其他实验室已发表文献
其余 皆由本实验
室开发
其中
对为本实验室尚未发表引物
所有引物均由上海
公司合成
1.3
实验方法
提取
剪取鳍条约
用于抽提
提取方法采 用 标 准 氯 仿
异 戊 醇
酒 精 提 取 程 序
用 琼 脂 糖
凝胶电 泳和紫外分 光光度计检 测
的纯度和体 积质量分数
并稀释成
的工作液
置于
备用
扩增
反 应 总 体 积 为
包 括
基 因 组
正 向 和 反 向 引 物
聚 合 酶
反 应 条 件 为
变 性
引 物 退 火
温 度
循 环
次
聚丙烯酰胺凝胶电泳
扩增产物用
的变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离
电泳设备为
公司的
电泳仪
和
电泳槽
电泳结束后进行 银染显色
具体参照
等
描述的
方法进行
等位基因片段大小依据
公司的
为参照标准进行判读
1.4
统计分析
本研究数据分析均在
软件中进行
用
程序对表型性状的频率分布进行正态分
布检验
用
菜单对
性状进行相关性分析
用
菜单中的
或
检验各微卫星位点的基因型和各位点的等位基因所对应生长性状的差异情况
对生长性
状影响显著的位点
使用
法进行不同基因型全长
体长
体高和体质量的多重比较
2
结果与分析
2.1
性状分布
对体长
体高
体质量数据的频率分布是否符合正态分布 的检验结果 见表
体长和体高 的
p
值分别
为
和
均大于
因此体长和体高的频率分布符合正态分布
体质量由于个体偏差较大
p
值为
但进行对数转换
后
p
值为
大于
表明经对数转换后的体质量频率分布符合正
态分布
表
1
体长
、
体高
、
体质量的正态分布检验
指标 平均值 偏度 丰度 最小值 最大值
p
值
体长
体高
体质量
体质量
西南大学学报
(
自然科学版
)
://
第
卷
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