matlab集成c代码-human_rat_metabolism:大鼠和人类新陈代谢的协调重建。包括用于生成iRno和iHsa的...

Matlab集成的c代码human_rat_metabolism 该存储库当前未维护或未使用。 查阅有关重建大鼠和人类代谢新物种的最新代码。 大鼠和人类新陈代谢的协调重建。 包括在iRno和iHsa重建过程中使用的脚本。 第一个脚本（在R中）直接比较了大鼠和人类代谢模型之间的基因-蛋白质React（GPR）的复杂性，如图2和3所示。此脚本输入了各种基因/蛋白质React（GPR）关系信息版本的iRno和iHsa可以比较大鼠和人类模型之间GPR大小的全球分布。 该脚本的目的是证明在优化iHsa到iRno的转化过程中以及在手动管理后对直系同源物进行优先排序后，物种间的GPR大小是一致的。 第二个脚本（在R中）验证了大鼠和人类之间与维生素C合成相关的已知差异，如图4所示。首先，此脚本再现了老鼠可以从头产生维生素C而人类不能产生维生素C的已知结果。 该脚本还再现了人类在生理条件下依赖维生素C的饮食来源的预测，这与坏血病的已知作用相一致。 使用R中的sybil工具箱，将助焊剂平衡分析应用于人工配制的iRno和iHsa，以测试维生素C在各种摄取率下的生长。 第三个脚本（R中）验证了大鼠和人之间与胆