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matlab代码sqrt-brainbowSegmentation:脑弓分割
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2021-05-23
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Matlab代码sqrt 欢迎 概述 运行mainScript.m 有关此方法的基础知识的演示可在此处获得: denoisingScript:去噪脑弓堆栈 superVoxelizationScript:切换到过度分段的“ supervoxel”表示形式 colorKmeans:基于颜色(LUV空间)的k均值聚类 computeNormalizedCuts_mem:超体素的半监督归一化分割分割 handleClusters:集群级操作(人机交互),为半监督的图割提供集群种子,即合并,拆分,清理 keepLargeClumps:仅当超体素子集形成足够大的连接组件(人类交互)以提供用于半监督图割的簇种子时,才保留它们。 可视化:包括可视化和文件写入脚本的目录 segProjectionWrite_script:脚本可在一幅大的2d图像中可视化所有群集的最大强度z投影。 segProjectionWrite_scriptXYZ:脚本可在一幅大的2d图像中可视化所有群集的最大强度x,y和z投影。 write3dTifForIndividualComponents_script:生成3d tif
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brainbowSegmentation-master.zip (96个子文件)
brainbowSegmentation-master
splitInconsistentSuperVoxels.m 5KB
mergeSupervoxels.m 6KB
writeProjectedSegmentationScript.m 2KB
topologyPreservingVolumeShrinkerWithPreference6.m 6KB
calculateOrientations.m 2KB
reportConfusionsAndRI.m 2KB
tempQscript.m 5KB
spatialAffinityBetweenObjectPairForLargeObjects.m 1KB
mainScript.m 4KB
cutDendrogram.m 3KB
colorInitializedWeightedKmeans.m 4KB
mergeSmallSuperVoxels.m 4KB
calculate_sAff.m 5KB
irbleigs.m 64KB
mergeClusters.m 2KB
supervoxelize.m 12KB
README.md 6KB
segmentImage.m 4KB
OLD
scMergerOnSubgraph.m 3KB
iterativeSpatioTemporalSupervoxelMerger.m 4KB
graphSupervoxelMergerWithMSSVandMSNSV.m 4KB
mergeSupervoxels.m 10KB
nCutsForSCMerging.m 3KB
graphSupervoxelMerger.m 3KB
removeSmallComponents.m 2KB
calculateNormalizedCuts_mem.m 10KB
denoisingScript.m 625B
spatialAffinityBetweenObjectPairForLargeObjects.m 1KB
simple_fkmeans.m 8KB
mergeConnComp2.m 5KB
mainScript.m 4KB
weightedKernelKMeans.m 1KB
splitHardSuperVoxels_kmeansNB.m 5KB
netLasso
brainbow_netlasso.m 1KB
brainbow_netlasso.py 4KB
license_distinguishable_colors.txt 1KB
superVoxelizationScript.m 7KB
mergeSubgraphs2.m 4KB
colorKmeans.m 677B
reconstruct1neuron.m 3KB
mergeConnComp3.m 4KB
mergeSmallSuperVoxels.m 3KB
calculate_sAff.m 5KB
distinguishable_colors.m 6KB
mergeConnectedComponentsWithinIndividualClusters.m 4KB
supervoxelize2.m 9KB
ss_fkmeans.m 8KB
irbleigs.m 64KB
analytics
readArborTrace.m 3KB
svPartitionFromTraces.m 1KB
splitHardSuperVoxels.m 4KB
randomlyPartitionBinaryGraph.m 2KB
vdpgm_countEstimate.m 273B
manipulateClusters.m 2KB
calculateNormalizedCuts.m 2KB
supervoxelize.m 8KB
README.md 5KB
demixSupervoxels5.m 5KB
mergeConnComp4.m 5KB
segmentImage.m 4KB
retainLargeClumps.m 1KB
spatialAffinityBetweenObjectPair.m 346B
mergeSingleNeighborSuperVoxels.m 4KB
denoise_BM4D.m 301B
segmentImage2.m 4KB
rgb2luv.m 1KB
graphSupervoxelMergerWithMSSV.m 4KB
newSplitHardSuperVoxels.m 5KB
fkmeans.m 7KB
showIndividualSuperVoxels.m 465B
assign6Boundaries.m 2KB
generateAffinityMatrix.m 6KB
singleNeuronReconstruction.m 2KB
generateAffinityMatrix2.m 6KB
mainScript2.m 5KB
newMergeWRTneighborsAndOrientations.m 5KB
visualization
segProjectionWrite_script.m 1KB
showIndividualSuperVoxelsXYZ.m 875B
correct_classification.m 3KB
segProjectionWrite_scriptXYZ.m 3KB
showClusterProjectionsCollage.m 3KB
svXYZ.m 396B
showIndividualSuperVoxels.m 465B
write3dTifForIndividualComponents.m 562B
calculateGraphAffinity.m 9KB
luv2rgb.m 1KB
mergeCloseNeighborhoods.m 3KB
mergeSingleNeighborSuperVoxels.m 3KB
rgb2luv.m 1KB
mergeWRTneighborsAndOrientations.m 5KB
demixSupervoxels.m 6KB
assign6Boundaries.m 2KB
generateAffinityMatrix.m 5KB
timingNotes.txt 10KB
removeSmallSupervoxels.m 1KB
luv2rgb.m 1KB
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