matlab集成c代码-ca_extraction_edit:来自epnev/ca_source_extraction;调试和添...

Matlab集成的c代码该代码的原始说明可在下面找到。 在此处添加了对钙成像数据集中轴突分割所做更改的摘要，并包括了一些其他测试数据集。 在demo_memmap_edit下可以找到效果最好的参数（例如，70 x 70像素的色块等）。 HALS初始化步骤和空间更新之间的其他稀疏性度量。 在补丁组件合并和时空更新之后，基于高时间相关性阈值合并组件。 删除组件并在order_ROI中进行其他排序。 包括像素阈值，线性度。 钙成像数据的去卷积和去混合 该代码实现了一种方法，用于同时从大型钙成像电影中进行信号源提取和峰值推断。 该代码适用于体细胞成像数据的分析。 将来将增加用于分析树突状/轴突成像数据的工具。 该算法在以下内容中有更详细的介绍 Pnevmatikakis，EA，Soudry，D.，Gao，Y.，Machado，T.，Merel，J.，...＆Paninski，L.（2016年）。 同时对钙成像数据进行去噪，去卷积和去混合。 神经元89（2）：285-299， Pnevmatikakis，EA，Gao，Y.，Soudry，D.，Pfau，D.，Lacefield，C.，...＆P