组装重叠序列,尤其是批量样本,是一项艰巨的任务。 此应用程序旨在帮助用户按样本将多组序列导入 MATLAB,将它们剪辑到公共参考序列(通过 Smith-Waterman 局部比对),确定它们的重叠(也是 Smith-Waterman),并将它们组装成单个全序列构建体。 可以使用预先格式化的 FASTA 或通过顺序复制到剪贴板来导入序列。 处理后,可以选择具有可接受长度和参考局部比对分数的构造进行导出。 导出选项包括在多次全局比对后将剪切的序列、核苷酸组装和/或蛋白质翻译提供给 FASTA、序列查看器应用程序和/或序列比对应用程序。 如果您发现此应用程序有用或希望看到任何更改/添加,请提供反馈。