MG
1队列模型MATLAB代码伽玛
Guess
Add
Mate算法(GAMA)用于最小基因组设计
GAMA和Minesweeper:全细胞模型的基因组设计算法
扫雷Github:
论文:Rees
and
Chalkley等人2019,(发布后更新)
协议书章节:(更新发布后的内容)
自述作者:Joshua
Rees,,github:squishybinary
奥利弗·查克利(Oliver
Chalkley),github:OliCUoB
隶属:英国布里斯托大学BS8TQ大学生命科学基因组设计小组
扫雷许可证:GNU通用公共许可证v3.0,gpl-3.0
GAMA许可证:GNU通用公共许可证v3.0,gpl-3.0
扫雷版本:0.9
GAMA版本:0.1(Chalkley等,2019,)
上次更新时间:2019-10-25
描述
该代码与生殖器支原体全细胞模型相结合,可通过大规模敲除建模基因而产生计算机内基因组设计。
两种算法都需要超级计算机来运行仿真。
GAMA算法还需要一台专用PC来自动拆分和监视整个集群中的仿真。
Minesweeper算法可以在非专用桌面上手动运行,其输出确定
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