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matlab终止以下代码-workflows_survey:工作流程调查
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2021-05-21
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matlab终止以下代码生物信息学工作流程和管道框架 剧本 用Unix shell或其他脚本语言(如perl或python)编写的脚本可以被视为管道框架的基本形式。 特别是,鲁棒性功能可能很脆弱,并且依赖于此管道上游和下游的依赖关系必须由作者自己手动解决。 同样,从框架的最后一个中断点恢复的可重入性也可能难以实施。 例如:是帮助杂合/多态基因组组装的管道。 要运行此管道,您的OS需要满足先决条件,并且通过在终端中键入命令,管道将开始运行,直到它生成输出或被异常中断为止。 最近,随着docker容器技术变得越来越流行,因此许多此类管道可以打包到映像中,以避免额外的安装。 制作 Make实用程序已成功用于管理科学计算管道通用的文件转换。 它引入了“隐式通配符规则”的概念,该概念基于文件后缀搜索文件和依赖项。 但是,make本身并没有为科学管道定义,因此,它具有一些局限性,例如没有对分布式计算的内置支持,缺少强大的数据结构以及不可能的复杂逻辑实现,这使其对于现代生物信息学不切实际。分析。 语法:隐式->任务(作业)应明确指定输入/输出文件名或文件名通配符。 语法:显式->任务(作业)取决于其
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