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FCS3.0-谷歌翻译中文1
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介绍实验复杂性。这些技术进步导致了包含描述信号方法的信息的要求定位其他段所需的纯文本字节偏移。仪器、标本、数据和归档的任何其他信息Cytometry 标准数据文
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1990年为FCS2.0。我们在这里报告提议的下一代流程
数据
包含描述实验的纯文本关键字‑值对,
能够
平均数据文件大小的增加超出了每个99,999,999字节的限制
扩大和增加对将时间纳入其中的支持
FCS3.0中包含的更改是必要的,因为
国际社会
包含实验数据。1984年第一个流式细胞仪标准
带有一个可选的分析段。HEADER首先出现并包含
包含描述用户指定分析的纯文本关键字‑值对
抽象的
提议的FCS3.0标准保持与以前的向后兼容性
流式细胞仪数据文件标准,版本FCS3.0
值,支持每个数据集的循环冗余校验(CRC)验证,
流式细胞仪数据文件读写软件的开发
在另一台计算机上。最初的FCS标准于1984年发布为
数据集设计到以前的FCS版本中。FCS3.0提供了一种机制
FCS2.0版可在Cytometry
1990;11(3):323‑32中找到。
是提供一种统一的文件格式,允许由一种类型的文件创建
创作者希望包括在内。DATA段包含实际的FCM数据
介绍
实验复杂性。这些技术进步导致了
包含描述信号方法的信息的要求
定位其他段所需的纯文本字节偏移量。TEXT段
仪器、标本、数据和归档的任何其他信息
细胞学(ISAC)
Cytometry标准数据文件格式,FCS3.0。标准的主要目标
测量参数。
FCS1.0(1)并于1990年修订为FCS2.0(2)。
不超过100兆字节限制的文件。电脑的成长
100兆及更大的数据集,支持关键字的UNICODE文本
标准委员会
分析型
数据文件格式采用FCS1.0,本标准修改为
在文件范围内完整描述流式细胞仪数据集
文件中的每个数据集包含三个段:HEADER、TEXT和DATA,
在一种仪器上通过实施的软件读取和分析
标准化格式。应用标准文件格式允许创建文件
避免此限制,同时保留这些数据的向后兼容性
保留基本FCS文件结构的版本。FCS结构要求
文件
流式细胞仪数据文件标准提供了所需的规范
数据。FCS3.0中提议的更改包括:处理机制
微机技术、计算机通信、仪器设计和
流式细胞术数据文件标准的目标是促进
采集硬件和软件要由另一种类型来分析。这
TEXT段中指定的几种格式之一。分析部分
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1.2一致性
流式细胞术领域的国际化导致需要在关键字值中加入国际字符。因此,通过提供关键字来支持
UNICODE字符集(3),已制定了一项规定,以支持对某些字符串使用多字节字符。
这是流式细胞术数据文件标准(FCS3.0)的3.0版。其目的是为在细胞仪上采集数据并将数据写
入文件而产生的数据集的结构提供详细规范。
网络导致了计算机之间大量数据的日常移动。这就需要一种确认文件完整性的方法。因此,FCS3.0
支持将循环冗余校验(CRC)字放置在每个FCS3.0数据集的末尾。使用CRC校验字可以检测文件传
输或读取期间发生的错误。时间越来越多地用作测量参数。因此,添加了关键字支持以更好地描述时间
的获取。
1.1范围
为了符合FCS3.0,数据文件必须符合本文档中描述的文件结构,并且必须在文件的
主要TEXT段中包含所有必需的关键字‑值对。符合标准的文件不得包含数据集
HEADER段中未描述的其他段。成为
1.一般
目录
1.一般1.1
范围1.2一
致性2.术语和一般要
求2.1约定2.2定义2.3一般概念3.文件段3.1标题段
3.2文本段3.3数据段3.4分析段3.5CRC值3.6其他
段4.参考文献5.附录5.1附录A‑与FCS2.0的区别
5.2附录B‑数据文件标准委员会成员5.3附录C‑提
议的用于读取和写入FCS文件的API
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2.2.4HEADER段将数据集标识为FCS3.0,并包含从数据集开头到每个其他段的开头和结尾的ASCII字
节偏移量。
2.1.2数值以10为底,除非另有说明。
2.2.7DATA段包含事件列表或数据直方图。
2.2.8事件是一个粒子的流式细胞仪测量结果的有序列表。事件的长度是测量中涉及的参数的数
量。
2.1.1ASCII字符代码用于整个FCS3.0文件中的所有关键字和大多数关键
字值(请参阅第3.2.20节关于使用UNICODE字符)。
2.1约定
2.2.6TEXT段包含一系列描述DATA段格式和大部分实验操作条件的ASCII关键字‑值对。主要
TEXT段包含所有必需的关键字‑值对。补充TEXT段仅包含可选的关键字‑值对。
2.2.1FCS3.0数据文件由一个或多个数据集组成。
参数值是参数的数字表示。
2.2定义
2.2.9参数是由细胞仪的其中一个检测器产生的信号。前向散射通常是测量参数之一。
2.2.3一个数据集中的信息集合被划分为至少四个段,包括一个HEADER段、一个主TEXT段、一个
DATA段和一个ANALYSIS段。ANALYSIS段可以是空的,并且任意数量的实现者定义的段可以跟
在前四个段之后。FCS3.0的新功能是包含一个可选的补充TEXT段。
2.2.2数据集定义为细胞仪在对一定数量的粒子进行测量时产生的信息集合。
2.2.5关键字是数据字段的标签。关键字‑值对是数据字段的标签及其关联值。
2.术语和一般要求
符合FCS3.0分析程序必须能够正确读取和解释任何最低符合FCS3.0的文件中包含的所有数据(最
低符合FCS3.0的文件是在TEXT段中仅具有所需关键字值对的文件)文件和分析段中没有信息)。
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3.文件段
2.2.10数据文件中的每个数据集都包含读取和解释数据集所需的所有信息。
第一个字节偏移(字节10‑17)是到主要TEXT段的开头。下一个字节偏移量(字节
18‑25)是主TEXT段末尾的偏移量。下一个偏移量(字节26‑33)是DATA段开始的偏移
量。DATA段结束的字节偏移占用字节34‑41。ANALYSIS段的开始占用字节42‑49。
ANALYSIS段结束的字节偏移在字节50‑57中。如果有
2.2.15“分隔符”是主要TEXT段的第一个字符,随后放置在主要TEXT、补充TEXT和
ANALYSIS段中,以将关键字与关键字值分开。分隔符可以是任何ASCII字符。
2.2.11文件中不包含在HEADER中指定的段中的所有空间必须用空格字符(ASCII32)
填充。这包括一个段的结尾和下一段的开头之间以及最后一个数据集的结尾和文件的结
尾之间的未使用空间。
3.1标题段
2.3一般概念
2.2.12列表模式数据存储是指事件一个接一个地存储在一个列表中。
2.2.13所有字节偏移都参考数据集的开头。文件中的第一个数据集从文件的字节零开始。
FCS3.0文件由一个或多个数据集组成,每个数据集至少包含HEADER、TEXT和
DATA段。HEADER、TEXT和ANALYSIS段包含文本编辑器可读的ASCII编码文本
(一些关键字值可能包含UNICODE字符;请参阅第3.2.20节)。
DATA段包含以列表模式或直方图形式存储的流式细胞仪数据。
3.1.1HEADER段的主要目的是描述数据集中其他段的位置。HEADER段从数据集开头
的字节偏移量0开始。HEADER段中的前六个字节包含版本标识符(FCS3.0)。注意,
FCS和标识符中的3.0之间没有空格字符。接下来的4个字节(6‑9)被空格字符(ASCII
32)占用。标识符之后是至少三对ASCII编码整数,分别指示主要TEXT段、DATA段和
ANALYSIS段的开始和结束的字节偏移量。字节偏移量参考数据集的开头。在FCS3.0下,这
些偏移量仍然限制为8个字节。每个ASCII编码的整数偏移量在其8字节空间中右对齐。
2.2.14实施者是创建软件以读取和写入符合FCS的数据文件的实体。
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数据段26‑33的第一个字节的ASCII编码偏移量
内容开始和结束字节位置
到ANALYSIS段50‑57的最后一个字节的ASCII编码偏移量
用户定义的其他段的ASCII编码偏移量58‑下一段的开始
表1.HEADER字段的内容和每个字段开头和结尾的字节偏移量。每个偏移量在其字段中右对
齐。
请注意,当一个段完全包含在数据集的前99,999,999个字节中时,该段的字节偏移量将
在TEXT段中作为关键字值复制。另请注意,如果HEADER中的ANALYSIS偏移量为零,则必
须检查$BEGINANALYSIS和$ENDANALYSIS关键字以确定是否存在ANALYSIS段。
到ANALYSIS段42‑49的第一个字节的ASCII编码偏移量
ASCII(32)‑空格字符06‑09
FCS3.0*********256****1545****1792**202456***0******0
FCS3.000‑05
一个示例HEADER段如下:
TEXT段18‑25的最后一个字节的ASCII编码偏移量
TEXT段10‑17的第一个字节的ASCII编码偏移量
*字符在这里用来表示一个空格字符。TEXT段从FCS3.0中“F”位置的第256
字节开始,到字节偏移1545结束。DATA段从字节偏移1792开始,到202456结束。没有
ANALYSIS段,所以开始和结束显示偏移量
与以前的FCS版本的一个主要变化是允许大于99,999,999字节的数据集。当段的任何
部分超出99,999,999字节限制时,将在HEADER中用0代替该段的开始和结束字节偏移
量。beginDATA、endDATA、beginANALYSIS、endANALYSIS(如果合适,开始和结束补
充TEXT)的字节偏移量只能在主TEXT段中作为关键字‑值对找到。
数据段最后一个字节的ASCII编码偏移量34‑41
noANALYSIS段最后两个字节偏移量可以设置为零(右对齐)或留空(填充空格字符)。
数据集的用户定义的OTHER段的开始和结束的偏移量遵循ANALYSIS段偏移量。除非数
据集创建者传递适当的信息,否则用户定义的段将无法被其他人解释。
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