收
稿日期
: 2018-09-15;
修回日期
: 2018-11-14
基金项目
:
国家自然科学基金资助项目
( 51365017,61463018)
;
江
西省自然科学基金面
上项目
( 20192BAB205084)
;
江
西省教育厅科学技术研究重点项目
( GJJ170491)
作者简介
:
梁礼明
( 1967-)
,
男
(
通
信作者
)
,
江
西赣州人
,
教授
,
硕导
,
硕士
,
主要研究方向为医学图像分析与机器视觉
( lianglm67@ 163. com)
;
盛
校棋
( 1994-)
,
男
,
山
东青岛人
,
硕士
,
主要研究方向为医学图像处理与机器学习
;
郭凯
( 1993-)
,
男
,
山
东聊城人
,
硕士
,
主要研究方向为机器学习
与机器视觉
;
邓广宏
( 1993-)
,
男
,
河
南信阳人
,
硕士
,
主要研究方向为机器学习和模式识别
.
基
于改进的
U-Net
眼底视网膜血管分割
*
梁
礼明
,
盛
校棋
,
郭 凯
,
邓广宏
(
江西理工大学
电气工程与自动化学院
,
江西 赣州
341000)
摘 要
:
针对视网膜血管图像特征信息复杂程度高
,
现有算法存在微血管分割较低和病理信息误分割等问题
,
提出一种融合
DenseNet
和
U-Net
网络的血管分割模型
。
首先
,
通过限制对比度直方图均衡化和
filter
滤波对图
像进行血管增强处理
;
其次
,
利用局部自适应
gamma
提升图像亮度信息并降低伪影的干扰
;
再次
,
由多尺度形态
学滤波局部增强微血管特征信息
;
最后
,
利用
U
型密集链接模块进行分割
。
该算法在
DRIVE
数据集上实验
,
其
平均准确率
、
灵敏度和特异性分别高达
96. 74% 、81. 50%
和
98. 20% 。
关键词
: U
型网络
;
视网膜
;
血管分割
;
形态学滤波
中图分类号
: TP391. 41
文献标志码
: A
文章编号
: 1001-3695( 2020) 04-062-1247-05
doi: 10. 19734 /j. issn. 1001-3695. 2018. 09. 0775
Improved U-Net fundus retinal vessels segmentation
Liang Liming
,Sheng Xiaoqi,Guo Kai,Deng Guanghong
( School of Electrical Engineering & Automation,Jiangxi University of Science & Technology,Ganzhou Jiangxi 341000,China)
Abstract: In vie w of complexing feature information in retinal vessels,and the existing algorithms have low microvascular seg-
mentation and pathological information mis-segmentation. Thus,this paper proposed a vessels segmentation model based on
DenseNet and U-Net networks. First,it performed image enhancement by restricting contrast histogram equalization and filter
filtering. Secondly,it used local adaptive gamma to improve retinal image brightness information and reduce artifact interfe-
rence. Then,multi-scale morphological filtering lo c a l l y enhanced microvascular feature information. Finally,it segmented the
optimized vessel image using a U-shaped dense connection module. The algori t hm has an average accuracy,sensitivity and spe-
cificity of 96. 74% ,81. 50% and 98. 20% by experimenting on the DRIV E dataset.
Key words: U-Net; retinal; blood vessels segmentation; morphological filtering
人的视网膜是一个具有极其丰富血管信息的光敏组织
,
且
是唯一具有非入侵和非
创伤可视化性质的组织
[1]
。
通
过对视
网膜血管的数量
、
角度
、
分支
、
曲度等分析
[2]
,
能够辅助医生诊
断
患者疾病
。
因此
,
视网膜血管系统的自动分析成为医学成像
领域的热点话题
。
大多数现有的无监督与有监督视网膜图像
分割方法都依赖于手工制作的特征来表征血管和非血管像素
之间的差异
。
如基于多尺度匹配滤波的眼底分割方法
[3]
,
该
方法利用分段线性近似呈高斯状强度分布的视网膜血管
,
在
阈
值化之前增强血管
,
虽然增强了大部分微小血管
,
但仍存在血
管交叉处分割不足
、
病灶误分割等现象
。Soares
等人
[4]
利
用不
同尺度
2D-Gabor
滤波是训练分类器实现血管像素检测的有效
代替方案
,
但此法仍存在微血管分割断裂的问题
。
其他的特征
还包括脊特征
[5]
、
矩
不变特征
[6]
、
局
部相位特征
[7]
、COSFIRE
滤
波
[8]
等
,
可
以较好地提取大部分血管特征
,
但抗噪性较差
,
易造成微血管分割断裂的现象
。
现有视网膜微血管通常具有
较低的对比度
,
并且与宽血管的强度差异往往大于背景的变
化
。
此外
,
还存在视盘
、
黄斑
、
病理和伪影等噪声的影响
。
虽然
上述方法都取得了较好的分割效果
,
但是这些人为选择的特征
在解决这两个问题时
,
仍然不能较鲁棒地解决血管变化趋势和
血管信息的不变性
,
造成微血管分割不足
、
病灶与视盘误分割
等问题
。
近年来
,
基于深度学习的特征学习方法被广泛地应用
于眼底视网膜血管分割
,
该类方法区别于人为的特征提取方
法
,
需另选较优的分类器完成最后的血管分割
。
其中深度学习
的卷积神经网络
( convolutional neural network,CNN)
将特征提
取与分类器相结合
,
具有更好的泛化能力和鲁棒性
[9]
。Orlan-
do
等
人
[10]
成功地将密集型条件随
机场
( conditional random
field,CRF)
模型与
CNN
相结合应用于视网膜血管分割
,
该模型
在图像内部建立远程链接
,
因此较好解决了收缩偏差的问题
,
但存在病灶误分割的现象
。Zhou
等人
[11]
利
用
CNN
提取血管
特征和一组滤波器提升微小血管
,
最后利用密集型
CRF
进行
血管分割
,
较好地解决了微血管分割不足的问题
,
但仍存在部
分微血管断裂
、
血管易链结等现象
。
针对上述算法存在的不足
,
本文提出一种在
U-Net
[12]
框
架
下的
DenseNet
[13]
的
分割模型
,
充分利用输出层的特征信息
,
并
在网络中加入空洞卷积提高网络提取血管特征信息的能力
,
从
而能更多地分割出微小血管
。
该方法融合限制对比度直方图
均衡化
( CLAHE) 、filter
滤波和多尺度形态学滤波增强主血管
与微血管信息
;
通过局部自适应
gamma
校正
,
纠正视网膜伪影
区域
。
最终将以上处理结果利用
DenseNet-U-Net
模型进行分
割
,
较好地解决了微小血管分割不足
、
视盘与病灶误分割的难
题
。
本文算法总体流程如图
1
所示
。
1
视网膜图像分割原理
1. 1
图
像预处理
考虑到经过采集的视网膜图像存在光照不均匀
、
血管中心
第
37
卷
第
4
期
2020
年
4
月
计算机应用研究
Application Research of Computers
Vol. 37 No. 4
Apr. 2020