NGS-analysis 二代测序数据分析

 # NGS-analysis 二代测序数据分析 ## 转录组 1. [RNA-seq分析流程](./RNA-seq.md) 2. [RNA-seq分析番外篇：细菌库过滤+饱和度分析](./RNA-seq%E5%88%86%E6%9E%90%E7%95%AA%E5%A4%96%E7%AF%87.md) 3. [差异表达分析：算法与原理](./Stat-on-RNAseq.md) ## 表观组 1. [MeRIP-seq分析流程](./MeRIP-seq.md) 2. [MeDIP-seq分析流程（未完结）](./MeDIP-seq.md) ## 重测序 1. [GATK4分析流程](./Try-CallSnp-using-GATK4.md) 2. [深入了解snp-calling流程](./call-snp.md) 3. [深入了解Structural Variation的分析方法](./Structural-Variation.md) 4. [基因型填充](./Genotype-Imputation.md) ## 宏基因组 1. [宏基因组分析基础：shotgun metageonome](./Analysis-of-Metagenome.md) 2. [宏基因组shotgun分析流程（未完结）](./Shotgun-Meta.md) 3. [宏基因组shotgun研究套路](./Analysis-Strategies-for-Shotgun-Metagenome.md) 4. [宏基因组16S分析流程](./Analysis-of-16S-metagenome.md) ## 三代测序 1. [三代测序入门](./Beginning-Single-Molecule-Sequencing.md) 2. [三代测序分析工具（未完结）](./%E4%B8%89%E4%BB%A3%E6%B5%8B%E5%BA%8F%E6%95%B0%E6%8D%AE%E5%88%86%E6%9E%90.md) ## 泛基因组 1. [泛基因组入门](./Begining-Pangenome.md) ## 群体遗传学 1. [群体遗传学知识点](./Population-Genetics.md)