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netMHCpan-4.1b.Linux.tar.gz
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2023-10-12
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netMHCpan-4.1b (linux) 利用人工神经网络预测肽与任何已知序列MHC分子的结合。该方法是在超过 85 万个定量结合亲和(BA)和质谱洗脱配体(EL)肽的组合上训练出来的。 BA 数据涵盖了来自人类(HLA-A、B、C、E)、小鼠(H-2)、牛(BoLA)、灵长类(Patr、Mamu、Gogo)、猪(SLA)和马(Eqca)的 170 种 MHC 分子。 EL 数据涵盖来自人类(HLA-A、B、C、E)、小鼠(H-2)、牛(BoLA)、灵长类(Patr、Mamu、Gogo)、猪(SLA)、马(Eqca)和狗(DLA)的 177 种 MHC 分子。 此外,用户还可以通过上传全长的 MHC 蛋白序列,对任何自定义的 MHC I 类分子进行预测。可以对任何长度的肽进行预测。
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netMHCpan-4.1b.Linux.tar.gz (17个子文件)
netMHCpan-4.1
Linux_x86_64
data
bin
nnalign_gaps_pan_play_MA_wgt_MN_v2_two_outputs_context_allelelist_pboth 160KB
mhcfsa2psseq 276KB
estimate_PCC 94KB
netMHCpan 173KB
netMHCpan-4.1.readme 5KB
netMHCpan.1 4KB
test
test.pep.out 4KB
test.pep 190B
test.fsa.out 100KB
test.pep_BA.out 4KB
test.pep_wBA.out 5KB
B0702.fsa 373B
NetMHCpan_out.xls 2KB
comm 280B
test.fsa 311B
test.pep_userMHC.out 5KB
netMHCpan 2KB
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子诚之
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