基于maxtree算法的半自动化3D图像分割标注软件.zip

该软件用于医学图像的分割标注，算法基于maxtree，界面基于Qt5。 只是一个Qt入门的demo，功能并不完全，算法也不优。 ## 界面  ## 测试图像下载 [google driver](https://drive.google.com/file/d/1kc2JBTVGw-p6TtxLaqPs5KmEiXVkOQLC/view?usp=sharing) ## 文件操作： - open：用于打开.nii.gz图像 - save：将编辑好的标签保存 - help：显示该帮助信息 - quit：退出软件 ## 编辑操作： - window：进入调节窗宽窗位模式，在图像上按住鼠标并上下左右滑动可调节窗宽窗位 - default window：使用默认的窗宽窗位，默认wc=400,ww=80 ## 选择ROI： - 2d roi：在当前的slice上选择2d的矩形区域进行标注 - 3d roi：在xy平面上选取矩形区域，结合begin和end生成3d的ROI - begin：将当前slice作为3d ROI的起始切片 - end：将当前slice作为3d ROI的终止切片 ## 分割算法： - tree：在当前ROI上计算maxtree - select：在当前ROI中选择一个初始点，该点在maxtree中对应一个节点，从该节点向上走到根节点的过程中，包含的区域逐渐增多，总面积逐渐增大，总面积随节点数量的变化曲线绘制在界面下方，在该曲线上点击鼠标，即可选择区域扩张的终点，即产生一个分割 - undo：舍弃当前分割区域（红色） - write：将当前分割区域（红色）写入分割标签（橘色） - show/hide：显示/不显示分割结果 ## 分割流程： - 鼠标在原图上移动可显示当前像素的xyz坐标和Hu值 - 在原图上选择ROI后，点tree生成该ROI的maxtree - 点select，鼠标在ROI内选择初始点，从初始点对应节点走到根节点的总面积变化曲线在下方显示 - 鼠标在面积曲线上选择一个点，即可得到一个临时分割区域（可重复选择） - 点undo可撤销此次临时分割（红色） - 点write可将临时分割区域（红色）写入最终分割标签（橘色） - 鼠标右键可删除最终分割标签中的连通域（橘色） - 点save保存分割标签 ## TODO： - 默认窗宽窗位可从图像中读取 - 窗口大小和布局写死了，需要优化 - 擦除连通域太慢了 - 可增加图像放大功能 - 可增加画刷和橡皮等常用标注工具 - 算法不好，鼠标选择一个初始点时，只能搜索比它更暗的区域，更亮的区域无法搜索到，结果是分割结果中间会形成少许空洞，后续可加上膨胀腐蚀的后处理