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home: true
heroImage: /reacnetgen.svg
heroText: ReacNetGenerator
tagline: An automatic reaction network generator for reactive molecular dynamics simulation
actionText: Get Started
actionLink: guide/
features:
- title: Trajectory
details: Processing of MD trajectory containing atomic coordinates or bond orders
- title: Filtering
details: Hidden Markov Model (HMM) based noise filtering
- title: Isomers
details: Isomers identifying accoarding to SMILES
- title: Network
details: Generation of reaction network for visualization using force-directed algorithm
- title: HTML5
details: Showing an interactive web page
- title: Fast
details: Parallel computing and performance optimization
footer: Copyright © 2018-2019 East China Normal University
---
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# Citation and contact
ReacNetGenerator: an automatic reaction network generator for reactive molecular dynamic simulations, Phys. Chem. Chem. Phys., 2020, 22 (2): 683–691, doi: [10.1039/C9CP05091D](https://dx.doi.org/10.1039/C9CP05091D)
jinzhe.zeng@rutgers.edu (Jinzhe Zeng), tzhu@lps.ecnu.edu.cn (Tong Zhu)
# Guide and Tutorial
See [the guide](guide/) to learn how to install and use ReacNetGenerattor. We also provide [a series of tutorials](tutorial/) to help you learn ReacNetGenerator.
# Awards
* The First Prize in 2019 (the 11th Session) Shanghai Computer Application Competition for College Students
* The First Prize in 2019 (the 12th Session) Chinese Computer Design Competition for College Students
# Acknowledge
* National Natural Science Foundation of China (Grants No. 91641116)
* National Innovation and Entrepreneurship Training Program for Undergraduate (201910269080)
* ECNU Multifunctional Platform for Innovation (No. 001)
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资源分类:Python库 所属语言:Python 资源全名:reacnetgenerator-1.4.136.tar.gz 资源来源:官方 安装方法:https://lanzao.blog.csdn.net/article/details/101784059
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reacnetgenerator-1.4.136.tar.gz (71个子文件)
reacnetgenerator-1.4.136
.travis.yml 705B
PKG-INFO 3KB
tutorial
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pyproject.toml 99B
renovate.json 77B
docs
tutorial
install.md 1KB
README.md 263B
zh
guide
README.md 1KB
build.md 1KB
README.md 2KB
.vuepress
config.js 3KB
public
CNAME 26B
reacnetgen.svg 2KB
guide
README.md 1KB
build.md 1KB
README.md 2KB
reacnetgenerator
reacnetgen.py 8KB
_draw.py 5KB
gui.py 5KB
utils.py 6KB
_logging.py 284B
test
test.json 2KB
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_path.py 9KB
_detect.py 13KB
_reaction.py 3KB
c_stack.cpp 569B
dps.pyx 2KB
static
img-title.png 2KB
webpack
reacnetgen.scss 269B
package.json 1KB
template.html 10KB
reacnetgen.css 1KB
fire.png 31KB
webpack.config.js 3KB
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reacnetgen.js 10KB
utils_np.pyx 1KB
__init__.py 603B
_reachtml.py 7KB
_hmmfilter.py 4KB
_matrix.py 5KB
_version.py 261B
_download.py 340B
c_stack.h 302B
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setup.cfg 38B
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recipe
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setup.py 7KB
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PKG-INFO 3KB
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top_level.txt 17B
dependency_links.txt 1B
zip-safe 1B
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