传染病学是医学领域的一个重要分支，主要研究各类传染病的发生、发展、传播机制以及预防和治疗方法。以下是对题目中涉及知识点的详细解释：
1. **右下肺部感染**：患者男性，40岁，出现寒战高热、右下胸痛等症状，体温39.7℃，呼吸频率增加，右下胸部叩诊呈浊音，这些都是肺部感染的典型表现，如肺炎。WBC（白细胞）计数升高至11乘以10^9/L，中性粒细胞比例0.82，提示存在细菌性感染。因此，右下叶肺炎是最可能的诊断之一。其他选项如原发性肺癌、细菌性肝脓肿、结核性胸膜炎、阿米巴肝脓肿也是需要考虑的疾病，但根据描述，肺炎的可能性相对较大。
2. **阿米巴肝脓肿的处理**：阿米巴肝脓肿是由溶组织阿米巴原虫引起的一种肝脏疾病，通常需要药物治疗。但当药物治疗无效或者脓肿较大、多发时，可能需要手术引流。题目中提到，左叶肝脓肿、右叶肝脓肿、多发性脓肿穿刺引流失败、继发性细菌感染或穿破入腹的情况，都是手术引流的指征。不过，对于一般大小且能通过药物控制的阿米巴肝脓肿，首选药物治疗而非手术。
3. **细菌性痢疾的诊断**：细菌性痢疾（简称菌痢）是由志贺菌引起的肠道感染。大便培养是确诊菌痢的金标准，因为可以直接分离出病原菌。大便光镜检可以发现脓细胞和红细胞，但不能区分病原体类型。大便涂片找细菌的敏感性较低，乙状结肠镜检可以观察肠道病变但并非必需。免疫荧光抗体法检测大便中的痢疾杆菌抗原是一种快速但可能不够特异的方法。
4. **菌痢的临床类型**：女性患者，反复出现腹痛、腹泻、脓血便和里急后重，符合菌痢的症状。急性菌痢普通型通常表现为急性发病，症状严重；轻型则症状较轻；迁延型是指症状持续超过两个月；慢性菌痢急性发作是指原本慢性病例的病情突然加重；隐匿型菌痢病人无明显症状，但粪便中可检测到病原菌。根据患者的病史，应诊断为急性菌痢普通型后的复发。
5. **菌痢的治疗**：对于细菌性痢疾，目前最有效的抗菌药物是诺氟沙星（氟哌酸），属于喹诺酮类药物，对志贺菌有良好抗菌效果。氯霉素曾是治疗菌痢的常用药物，但由于耐药性和毒性问题，现已不作为首选。黄连素具有一定的抗菌作用，但疗效可能不如诺氟沙星。复方磺胺甲噁唑（复方新诺明，SMz-TMP）也是一种常用的抗菌药物，但对部分菌株可能出现耐药。
这些题目涉及到的知识点包括肺部感染的诊断与鉴别诊断、阿米巴肝脓肿的治疗原则、细菌性痢疾的确诊方法、临床分型及其治疗。了解这些知识点对于理解和处理相关疾病的诊断和治疗至关重要。
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