"基于GPU的快速能谱图生成方法"
本文介绍了一种基于GPU的快速能谱图生成方法,旨在解决传统基于CPU的能谱图生成方法中存在的计算时间过长的问题。该方法通过利用Nvidia公司的GPU并行计算标准CUDA,实现了粒子能量统计、最大值bin的查找和绘制能谱图,并将数据传输瓶颈问题解决,使得能谱图的生成时间大大缩减。
1. 能谱图原理和实现方法
能谱图是一种描述粒子能量分布的图形,常用于医用加速器领域。在CPU上实现能谱图时,将加速器释放粒子的能量范围均匀划分为n个区间,每个能量区间称之为一个bin,然后依次统计收集到的粒子的能量分布。在CPU上单线程实现能谱图时,关键代码如下所示:
for( int i = 0; i < DATA_NUM; i++ ) {
bin = Data[i] / (bins - 1);
Spectrum[bin]++;
}
然而,随着粒子数目的增加,计算时间呈级数增长,影响了能谱图的生成速度。
1.1 GPU上统计能谱
为了解决计算时间过长的问题,本文介绍了一种基于GPU的快速能谱图生成方法。GPU具有特殊的编程模型,可以将内存分为全局内存、共享内存和纹理内存三种。为了提高统计速度,本文中使用全局内存和共享内存,根据GPU编程模型,每一个block设置128个线程,每个线程负责64个数据,在每一个block的共享内存里面,形成一个子能谱图(sub-Spectroscopy),在所有线程完成子能谱图统计之后,在全局内存中设置能谱图,将子能譜图累加到能谱图中。
1.2 计算最大的bin值
为了在屏幕上有限区域显示能谱图,需要根据显示面积的高度,按比例压缩所有的bin值。为了计算出压缩比例,首先需要计算出所有bin里面的最大值。在CPU上使用串行方法计算最大bin值,代码如下所示:
max_bin = 0;
for( int i = 0; i < 256; i++ )
if( spectrum[i] > max_bin )
max_bin = spectrum[i];
然而,在GPU上计算最大bin值,需要采用线程同步树形计算方式,原理如图2所示,在计算最大值时,同时启动256个线程,每个线程负责计算子能谱图的最大值,然后将子能譜图的最大值累加到能谱图中。
实验结果表明,与只使用CPU和只使用GPU进行数据统计而不进行结果显示的两种方案相比,在处理大量粒子数据时,能够获得80倍以上的加速比。
本文介绍了一种基于GPU的快速能谱图生成方法,旨在解决传统基于CPU的能谱图生成方法中存在的计算时间过长的问题。该方法通过利用GPU的并行计算能力,实现了粒子能量统计、最大值bin的查找和绘制能谱图,并将数据传输瓶颈问题解决,使得能谱图的生成时间大大缩减。