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2024-中药网络药理学-教程(全网最牛逼)

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中药网络药理学-教程(全网最牛逼)

1. 首先uniprot官网下载数据

1.1. 数据下载

• 地址：https://www.uniprot.org/

•

• 我这里研究的是胶质母细胞瘤(GBM)，glioblastoma

，输入进去，然后就会得到对应的数据

•

• 这里需要注意，不能直接下载txt文件，我们这里需要下载tsv的文件，然后进行转

换为txt文件

•

1.2. 数据整理

•

1.3. 新建文件夹[代码处理]

• 新建文件夹，命名为：1uniprot，如图所示：

•

• import pandas as pd

读取

.tsv

文件

df = pd.read_csv('uniprotkb_glioblastoma.tsv', sep='\t')

将

DataFrame

写入

.txt

文件

df.to_csv('ann.txt', sep='\t', index=False)

• 我们将文件转换为.txt的格式

•

2. 疾病中药交集

2.1. 找到中药的复方药剂

2.1.1.

首先去

TCSMP

官网

• 地址：https://old.tcmsp-e.com/

•

• 然后就需要去筛选OB,DL，OB需要>=30，DL>=0.18,如下图所示：

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