Gaussian03是一款广泛使用的量子化学计算软件,它允许用户模拟分子的电子结构,从而预测其化学性质。在Gaussian03中,Link0命令是一个关键的预处理指令,用于设置计算的初始条件和资源分配。以下是关于Gaussian03 Link0命令的详细解释: 1. `%Mem=N`: 此命令用来指定程序在运行过程中动态分配的内存大小。默认是6MW(兆字节),N后面可以跟KB、MB、GB、KW、MW或GW作为单位。例如,`%Mem=1GB`表示分配1GB的内存。 2. `%Chk=文件名`: 这个命令用于指定checkpoint文件的位置和名称。Checkpoint文件存储了计算的中间结果,以便于中断后恢复计算或者用于后续的优化和频率分析。 3. `%RWF=文件名`: 此命令用于设定标准读写文件的位置和命名。如果计算数据量大,可以使用`%RWF=位置1,尺寸1,位置2,尺寸2,...`来在多块硬盘上分散存储,提高效率。尺寸可以是-1表示使用所有可用空间,0则保持原有大小。 4. `%Int=spec`: 用于指定双电子积分文件的位置和命名,这对于大型计算尤其重要,因为双电子积分是计算中的关键部分。 5. `%D2E=spec`: 类似于`%Int`,但用于指定双电子积分导数的文件。 6. `%KJob LN [M]`: 这个命令让程序在执行Link N的第M次事件后停止,方便调试和分析。 7. `%Nproc=N`: 在g03.D.01版本中,此命令用于指定并行计算使用的处理器数量。但在后来的版本中,它已经被废弃,取而代之的是通过Default.Route文件或特定的并行环境变量来设置。 8. `%NProcShared=N`: 用于指定作业请求的共享内存处理器数量,适用于支持共享内存并行计算的系统。 9. `%NProcLinda=N`: 在分布式内存并行计算环境中,这个命令指定请求的节点数量。`%NProcl`和`%NProcs`是`%NProcLinda`的别名。 10. `%LindaWorkers=node1[:n][,node2[:n]...]`: 新增的Link 0命令,用于指定节点名称及其上的Linda Worker进程数量,Linda是Gaussian并行计算框架的一部分。 11. `%Save` 和 `%NoSave`: 这两个命令控制计算完成后草稿文件的保留策略。`%Save`会保存所有草稿文件,而`%NoSave`会删除未命名的草稿文件以及在此之前命令的草稿文件。 12. `%Subst LN dir`: 此命令允许用户从指定的目录加载Link N的执行文件,这对于使用自定义编译的模块或不同版本的程序非常有用。 了解和正确使用这些Link0命令对于优化Gaussian03的计算性能和资源管理至关重要。它们允许用户根据计算需求调整内存分配、文件存储位置、并行计算参数等,从而最大化计算效率和资源利用率。在编写Gaussian输入文件时,熟练运用这些命令能够更好地控制计算流程,解决复杂的化学问题。
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