三代基因组测序技术简介及其原理整理
第一代测序技术
第一代 DNA 测序技术用的是 1975年由桑格( Sanger)和考尔森
(Coulson)开创的链终止法以及 1976-1977年由马克西姆( Maxam)和
吉尔伯特( Gilbert)发明的化学法(链降解)。
1977年,桑格测定了第一个基因组序列 —— 噬菌体 X174,全长
5375个碱基。自此,人类获得了窥探生命遗传差异本质的能力,并以此
为开端步入基因组学时代。研究人员在 Sanger法的多年实践之中不断对
其进行改进。在 2001年,完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的
Sanger法为其测序基础。
Sanger法原理:
1)在模板指导下, DNA聚合酶不断将 dNTP(N=A/G/T/ C)加到引
物的 3’- OH末端,合成出新的互补链。在 4个DNA合成反应体系中分别加
入一定比例带有放射性同位素标记的 ddNTP,在互补链在 DNA聚合酶作
用下延伸时,一旦连接上 ddNTP,由于双脱氧核糖的 2’和3’都不含羟
基,故不能同后续的 dNTP形成磷酸二酯键而终止反应,随即形成一系列
不同长度的、以同样引物为起始、以同一碱基终止的短片段混合物。
2)双脱氧核苷酸在每个 DNA分子中掺入的位置不同,采用聚丙烯
酰胺凝胶电泳区分长度差一个核苷酸的单链 DNA,从而读取 DNA核苷酸
序列。
化学裂解法原理:
与Sanger法类似,将 DNA模板分成 4个反应。在每个反应中,先在模
板5’端进行放射性标记,再加入能特异性在其中一种碱基处切开 DNA的
化学试剂。反应进行时,平均一个 DNA分子只在随机位点产生一次裂
解。接着,通过凝胶电泳和放射自显影后可以根据电泳带的位置确定待
测分子的 DNA序列。
第二代测序技术
第一代测序技术的主要特点是测序读长可达 1000bp,准确性高达
99.999%,但其测序成本高,通量低等方面的缺点,严重影响了其真正
大规模的应用。因而第一代测序技术并不是最理想的测序方法。经过不
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