该股东合伙合作协议主要涉及的是两个主体——投资甲方和技术乙方之间的合作事宜，旨在共同投资建厂或设立有限公司。协议的核心内容包括以下几个方面：
1. 合作项目确认：双方已经了解并决定在某一范围内共同实施特定项目，明确了计划的年产规模。
2. 投资方式与资金平衡：甲方负责投入自有资金和房地产，乙方负责投入其拥有独立产权的单项技术。甲方根据技术和经济价值的匹配度以及项目规模投入总资金，并设定启动资金，双方投入的资金和产权成为共有财产，任何一方不得单方面撤回或独占。
3. 注册资金：采用现金注册方式，注册资金仅反映实际投入的资金，知识产权不计入注册资金。
4. 利润分配与风险承担：遵循“对等公平、险利均担”的原则，双方平分利润，共同承担风险，股份比例通常为50%对50%，在特殊情况下，技术方可能占股35%。
5. 生产运营模式：合作企业采用共同生产经营模式，乙方主要负责技术及关键部件生产，甲方负责日常运营和手续办理。
6. 产权归属：合作工厂或公司的产权归双方平均所有，按股份比例享有分红。
7. 组织结构：成立董事会，双方各占一半职位，董事长由甲方担任，乙方担任副职，董事享受年月补贴，同时可能根据职务等级额外计酬。
8. 子企业优惠政策：子企业作为集团的相对独立法人，可以享受项目改进的优惠待遇，也可以选择成为独立企业。
9. 专利权约定：技术方保留项目的专利权、后续改进权和相关附属产品的专利申报权，甲方实施的项目可以是普通实施或市排他实施。
10. 合作程序：选择项目签订意向书，然后正式签约并支付技术保险金或科技资助费，启动资金到位后技术方提供技术资料，开始建厂、招聘和生产准备。
11. 法律责任：若投资方小试未成功，双方需查明原因，若技术有误，需退还保险金；若非技术问题，技术方应协助解决，直至成功，相关费用由合作公司支付。任何一方违约需赔偿对方。
12. 时效制度：协议设定了明确的时间节点和执行期限，确保合作流程的有序进行。
此协议详细规定了股东之间的权利义务关系，旨在保障双方在投资建厂过程中的权益，确保项目的顺利实施。通过这种合作协议，双方能够共享资源，共同承担风险，实现共赢。
