目前已广泛用于外源基因表达和研究的酵母菌包括:
酵母属 如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae )
克鲁维酵母属 如乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis )
毕赤酵母属 如巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris )
裂殖酵母属 如非洲酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe )
汉逊酵母属 如多态汉逊酵母(Hansenula polymorpha )
其中酿酒酵母的遗传学和分子生物学研究最为详尽,但巴斯德毕
赤酵母表达外源基因最理想。