关于长链非编码RNA与疾病的关联预测研究综述.docx

长链非编码RNA（lncRNA）是一种长度超过200个核苷酸但不编码蛋白质的RNA分子。尽管早期被视为基因表达的“噪声”，近年来的研究揭示了lncRNA在生物学过程中扮演的重要角色，包括细胞增殖、分化、表观遗传调控等。更重要的是，lncRNA的异常表达与多种疾病的发生，如癌症和自身免疫疾病，有着密切关联。 传统实验方法在探究lncRNA与疾病关系时，面临周期长、成本高的问题。因此，科研人员转向利用生物信息学和计算模型来预测lncRNA与疾病之间的关联，以期缩短研究周期、提高效率并降低成本。这些计算模型主要分为两大类：基于生物网络的方法和基于机器学习的方法。 基于生物网络的方法通常依赖于lncRNA、miRNA（微小RNA）、疾病和基因之间的相互作用。例如，Fan等人提出的IDHI-MIRW模型利用网络拓扑结构，结合lncRNA表达谱、lncRNA-miRNA、lncRNA-蛋白质相互作用等信息进行预测。而Yu等人开发的BRWLDA模型则结合lncRNA-miRNA、miRNA-疾病和lncRNA-基因关联，利用双向随机游走进行预测。Chen等人改进了随机游走模型，提出IRWRLDA，特别适用于预测与lncRNA无已知关联的疾病。Zhang等人构建的LncRDNetFlow则整合多个网络，利用流传播算法预测lncRNA-疾病关联，但这种方法可能因数据整合和计算耗时而受到限制。 基于机器学习的方法通常涉及训练算法以识别lncRNA和疾病的模式。这些模型可能包括支持向量机、决策树、神经网络等。它们通过学习已知的lncRNA-疾病关联数据，构建预测模型来预测未知关联。这类方法的优势在于可以自动从大量数据中学习特征，但参数优化和过拟合问题仍是需要解决的关键挑战。 目前的研究中，许多模型都试图克服数据稀疏性和噪声问题，以及提高预测精度。然而，如何有效地整合各种类型的生物学信息，优化网络结构，选择最佳参数，仍然是计算模型面临的共性问题。未来的研究方向可能包括开发更复杂、更精确的模型，改进现有算法，以及深入理解lncRNA的功能机制，以便更好地预测其与疾病的关系。 lncRNA与疾病关联预测的研究正在迅速发展，计算模型作为有力工具，有望为疾病诊断、治疗策略制定和新药研发提供重要线索。随着生物信息学技术的进步，未来我们有望看到更多高效、精准的预测模型，从而推动lncRNA研究进入新的阶段。