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学术干货共聚焦显微镜中荧光团共定位.pdf
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学术干货:共聚焦显微镜中荧光团的共定位
在多标荧光样品图像中,因两个或多个荧光团在显微结构中距离很近,经
常会有发射信号叠加,这种效应就称为共定位。目前,高特异性合成荧光
团和经典免疫荧光技术的应用、精密光切技术的应用、共聚焦和多光子显
微镜提供的数字图像处理技术等大大提高了生物样品中共定位检测的能
力。
图 1
共定位在生物表述上是这样定义的:两个或多个不同的分子位于样品上同
一个物理位置。对显微镜中看到的组织切片、单个细胞或亚细胞器官,共
定位意味着不同的分子连接到同一个受体上;在数字图像方面,这个术语
指的是不同荧光分子发射的颜色分享图像中的同一个像素。在共聚焦显微
镜中,样品被记录成含有很多像元的多维阵列数字图像,每个像元代表一
个三维像素。像元的尺寸(或检测单元)由物镜的数值孔径、照明波长以
及共焦检测针孔直径等决定。因此,在一个样品中两个荧光探针的共定位,
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比如发绿光的 Alexa Fluor488,发橘红色光的 Cy3,在图像中就是由含
有红色和绿色两者贡献的像素表示(经常产生各种各样的橘色和黄色)。
举一个例子, 图 1 的一系列图表明了骨骼肌动蛋白和黏着斑蛋白侧向光
学平面上的共定位(激光扫描共聚焦显微镜中的 XY 面)。这些共定位点
可作为肌动蛋白丝的成核位点,也可作为外部介质、质膜和肌动蛋白骨架
之间的交联剂。图 1( a)是 Alexa Fluor 568 通道(目标对象是黏着斑
蛋白),由 543nm 的氦氖激光器激发;而 Figure1( b)是 Alexa Fluor488
通道(目标对象是丝状肌动蛋白),由 488nm 的氩离子激光器激发;
Figure1( c)是前面两幅图的叠加,表明两种荧光信号在丝状肌动蛋白纤
维末端的共定位。必须指出的是,共定位并不指的是具有相似发射光谱的
荧光团出现在合成图像的同一个像素上。准确的共定位分析只有在荧光团
的荧光发射光谱足够分离且滤色片(或光谱狭缝宽度)正确设置的情况下
才有可能。荧光团发射光谱之间的大量叠加或滤色片组合的不正确使用,
都可能导致光谱串色,这种情况下共定位的测量就没有意义。为了避免产
生共定位假象,荧光团必须与照明光源的光谱认真匹配(共聚焦中是激光
线),来获得最大激发效率,同时在发射光谱之间保持一定的分离度。在
大多数情况下,对共定位分析来说,荧光团的选择对获得满意结果极为重
要。
在图 2 中,对 Alexa Fluor 染料家族的光谱叠加作了比较,这在共定位
实验中是很有用的。为了比较,所有的发射光谱都做了归一化,叠加区域
用灰色阴影显示。在图 2(a) 中,绿色荧光染料 Alexa Fluor 488 和橙黄
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色荧光染料 Alexa Fluor 555 在峰波长处显示很明显的分离,人眼也很容
易能够区分。然而,光谱叠加(灰色阴影区域)表明在 Alexa Fluor 555 的
发射峰上很明显有 Alexa Fluor488 的发射光谱(用一条黑线标示,从发
射峰到横坐标)。当 Alexa Fluor 488 的荧光发射强度明显比 Alexa Fluor
555 的荧光发射强时,荧光信号这么高程度的串色使得荧光探针的分离很
难。很多因素都会导致这种情况发生,比如荧光团标的物浓度的巨大差异。
因此,在共定位实验中,这些探针的组合就应该避免,或只有当图像在多
通道共焦模式采集下才可以使用,这样可以降低或消除串色。
图 2
Alexa Fluor 探针之间的光谱叠加程度会随着探针发射峰之间的距离增加
而下降,如 Figure2(b)所示。在这种情况下, Alexa Fluor 488 和深红色
染料 Alexa Fluor 633 与 Figure2 (a)比较,重叠区域明显降低。这两种染
料人眼都很容易区分,光谱重叠程度低在共定位实验中可使串色最小化,
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如每个探针的浓度相似的话,应该可以产生较好的结果(注意:深红色的
荧光染料 Alexa Fluor 633 在低浓度时通过显微镜目镜很难观察到)。
Alexa Fluor 633 可被红色氦氖激光器的 633nm 线最有效的激发,也可
被黄色氦氖激光器的 594nm 激发。或许,在 Alexa Fluor 染料发射的可
见光区域,最好的光谱分离是 Alexa Fluor 488 和 Alexa Fluor 647 的结
合(图中未显示)。实际上,在这些染料之间没有光谱重叠,即使样品含
有过量的 Alexa Fluor 488,应该也没有串色。具有这些特点的荧光探针
是共聚焦显微镜分析共定位的理想选择。
在共聚焦显微镜中,测定共定位的能力受限于光学系统的分辨率及用于照
明样品的入射光波长。宽场荧光和共聚焦显微镜理论分辨率约为 200nm,
但在实际上,由于各种原因这个数降到 400nm 和 600nm 之间,原因包
括显微镜光路未完全对准、光学折射率波动、光学像差及样品制备的不合
适。然而,对于一个已经完全调好的共聚焦显微镜来说,两个荧光分子是
否连接到同一个目标对象上,或者它们是否定位在同一个器官上受光学分
辨率影响。共定位的许多实验是围绕高特异性的合成探针和抗体进行的,
标记目标是容易区分的局部的、明确的细胞结构。
对于厚度小于 5μm 的样品,比如贴壁细胞或很薄的组织切片,在常规的
宽场荧光显微镜下,定量的共定位分析一般是可以的。然而,对于厚样品,
图像应以具有一定轴向尺寸的光学切片来记录,来分析看起来共定位的荧
光团是否真正位于同一个侧向焦平面上,或在 Z 轴上他们是否彼此叠加。
厚样品的荧光团共定位分析应通过获得薄的光学切片来进行,可用激光扫
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描共聚焦显微镜、或转盘共聚焦显微镜或多光子显微镜。多光子显微镜经
常用单个近红外激光,在物镜焦点处的特定区域激发双标样品的两个荧光
团。这些技术将荧光发射局限在仅位于焦平面上的荧光团,这样大大降低
了光漂白和背景噪音。
共定位的软件分析
样品中荧光团共定位的程度是通过比较一幅图上每个像素位置的颜色值
测定的。分析的第一步就是要显示进行共定位测量的图,一般以两个独立
通道的合成图显示。当分析多标样品时,在一次计算中,只能处理两种伪
彩,但所有伪彩排列之后都可以配对用于共定位分析。由于传统上使用氩
离子激光器、氪-氩离子激光器及氦氖激光器,这些激光器能够有效地激发
在蓝色和绿色区域有强烈吸收的荧光团,因此选择红绿颜色对作为共聚焦
荧光颜色。此外,人眼对绿色和红色色调更为敏感。
图像的共定位分析一般经常用散点图表示( scatterplot),这个图将两套
数据关联起来。散点图以二维图的形式描述了一幅图或一个感兴趣区域每
个像素处一个通道对另一个通道的强度值(见图 3 和图 4)。作图时其
中一个通道(通常是绿色)作为 x 轴,而另一个通道(通常是红色)作
图时作为 y 轴,在横坐。标和纵坐标上强度范围是 0 4095. 因此,合成
图的每个像素点都有一对强度值。分析每一对强度值产生的分布图案,能
够识别荧光团的共定位、区分背景、串色、光漂白等。
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