基于知识图谱和推荐系统的药物靶标相互作用预测python源码(含操作说明).zip

【资源说明】 基于知识图谱和推荐系统的药物靶标相互作用预测python源码(含操作说明).zip 本代码使用yamanishi_08数据集，其他数据集请自行处理 进入data文件夹运行对应数据集的.py文件来下载数据集 进入eg_model文件夹运行eg_model.py来下载kge模型 运行环境 kge_nfm.py kge_rf.py: python 3.7 Tensorflow 1.15.0 cuda 10.0 deepdti.py: Pytorch 1.11.0 cuda 11.3 可以使用pyenv管理python版本，使用pipenv创建虚拟环境 创建虚拟环境 在当前项目根目录下运行命令 ``` pipenv --python 3.7 ``` 安装requirements.txt中的依赖 ``` pipenv run pip install -r requirements.txt ``` 安装rdkit拓展 ``` pipenv run pip install git+https://github.com/bp-kelley/descriptastorus ``` 使用train_all.py一键运行 ``` pipenv run python train_all.py ``` 程序运行日志保存在logs文件夹 输出结果保存在output文件夹，包含曲线上的点、auc以及模型 【备注】 1、该资源内项目代码都经过测试运行成功，功能ok的情况下才上传的，请放心下载使用！ 2、本项目适合计算机相关专业(如计科、人工智能、通信工程、自动化、电子信息等)的在校学生、老师或者企业员工下载使用，也适合小白学习进阶，当然也可作为毕设项目、课程设计、作业、项目初期立项演示等。 3、如果基础还行，也可在此代码基础上进行修改，以实现其他功能，也可直接用于毕设、课设、作业等。 欢迎下载，沟通交流，互相学习，共同进步！