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Linux 上机操作 10
一、实验目的
1.掌握 conda 的安装
2.掌握 conda 虚拟环境的搭建
二、实验内容
1.在 linux 系统中安装 conda。
2.通过 conda 安装特定版本的 python。
3.通过 conda 安装软件包。
4.通过 condo 新建环境,删除环境。
Linux 作业 7:
一、基础题(*简述一下软件或包 samtools,gseapy,ggplot2 的作用(100 字),针对每
个软件要学会阅读官网提供的安装使用说明,并搜索软件的安装和使用教程)
samtools 的作用:用于处理 SAM/BAM/CRAM 格式的文件,用于进行编辑、建索引、二
进制查看、格式转换、过滤提取基因组序列比对数据等,结合 sam 格式中的 flag、tag 等
信息,还可以完成比对结果的统计汇总。通过 samtools,我们可以进行基因组数据的分析
和可视化。
gseapy 的作用: gseapy 是一个用于基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,
GSEA)的 Python 库。它允许用户通过富集分析揭示在基因表达数据中显著富集的生物学
通路和功能。gseapy 与 gsea 数据库集成,提供了一种快速而强大的工具来解释基因表达
实验的结果。
ggplot2 的作用:ggplot2 是 R 语言中的一个数据可视化包,用于创建图表。它基于图形语
法理论,允许用户通过构建图层的方式轻松地创建各种类型的图表,包括散点图、折线图
和直方图等,保有命令式作图的调整函数,使其更具灵活性,绘制出来的图形美观,同时
避免繁琐细节。