haole # QABasedOnMedicaKnowledgeGraph
self-implement of disease centered Medical graph from zero to full and sever as question answering base. 从无到有搭建一个以疾病为中心的一定规模医药领域知识图谱,并以该知识图谱完成自动问答与分析服务。
# 项目介绍
知识图谱是目前自然语言处理的一个热门方向,关于较全面的参考资料,可以查看我的ccks2018参会总结(https://github.com/liuhuanyong/CCKS2018Summary )。
与知识图谱相关的另一种形态,即事理图谱,本人在这方面也尝试性地积累了一些工作,可参考:(https://github.com/liuhuanyong/ComplexEventExtraction )
关于知识图谱概念性的介绍就不在此赘述。目前知识图谱在各个领域全面开花,如教育、医疗、司法、金融等。本项目立足医药领域,以垂直型医药网站为数据来源,以疾病为核心,构建起一个包含7类规模为4.4万的知识实体,11类规模约30万实体关系的知识图谱。
本项目将包括以下两部分的内容:
1) 基于垂直网站数据的医药知识图谱构建
2) 基于医药知识图谱的自动问答
# 项目最终效果
话不多少,直接上图。以下两图是实际问答运行过程中的截图:
![image](https://github.com/liuhuanyong/QABasedOnMedicalKnowledgeGraph/blob/master/img/chat1.png)
![image](https://github.com/liuhuanyong/QABasedOnMedicalKnowledgeGraph/blob/master/img/chat2.png)
# 项目运行方式
1、配置要求:要求配置neo4j数据库及相应的python依赖包。neo4j数据库用户名密码记住,并修改相应文件。
2、知识图谱数据导入:python build_medicalgraph.py,导入的数据较多,估计需要几个小时。
3、启动问答:python chat_graph.py
# 以下介绍详细方案
# 一、医疗知识图谱构建
# 1.1 业务驱动的知识图谱构建框架
![image](https://github.com/liuhuanyong/QABasedOnMedicalKnowledgeGraph/blob/master/img/kg_route.png)
# 1.2 脚本目录
prepare_data/datasoider.py:网络资讯采集脚本
prepare_data/datasoider.py:网络资讯采集脚本
prepare_data/max_cut.py:基于词典的最大向前/向后切分脚本
build_medicalgraph.py:知识图谱入库脚本
# 1.3 医药领域知识图谱规模
1.3.1 neo4j图数据库存储规模
![image](https://github.com/liuhuanyong/QABasedOnMedicalKnowledgeGraph/blob/master/img/graph_summary.png)
1.3.2 知识图谱实体类型
| 实体类型 | 中文含义 | 实体数量 |举例 |
| :--- | :---: | :---: | :--- |
| Check | 诊断检查项目 | 3,353| 支气管造影;关节镜检查|
| Department | 医疗科目 | 54 | 整形美容科;烧伤科|
| Disease | 疾病 | 8,807 | 血栓闭塞性脉管炎;胸降主动脉动脉瘤|
| Drug | 药品 | 3,828 | 京万红痔疮膏;布林佐胺滴眼液|
| Food | 食物 | 4,870 | 番茄冲菜牛肉丸汤;竹笋炖羊肉|
| Producer | 在售药品 | 17,201 | 通药制药青霉素V钾片;青阳醋酸地塞米松片|
| Symptom | 疾病症状 | 5,998 | 乳腺组织肥厚;脑实质深部出血|
| Total | 总计 | 44,111 | 约4.4万实体量级|
1.3.3 知识图谱实体关系类型
| 实体关系类型 | 中文含义 | 关系数量 | 举例|
| :--- | :---: | :---: | :--- |
| belongs_to | 属于 | 8,844| <妇科,属于,妇产科>|
| common_drug | 疾病常用药品 | 14,649 | <阳强,常用,甲磺酸酚妥拉明分散片>|
| do_eat |疾病宜吃食物 | 22,238| <胸椎骨折,宜吃,黑鱼>|
| drugs_of | 药品在售药品 | 17,315| <青霉素V钾片,在售,通药制药青霉素V钾片>|
| need_check | 疾病所需检查 | 39,422| <单侧肺气肿,所需检查,支气管造影>|
| no_eat | 疾病忌吃食物 | 22,247| <唇病,忌吃,杏仁>|
| recommand_drug | 疾病推荐药品 | 59,467 | <混合痔,推荐用药,京万红痔疮膏>|
| recommand_eat | 疾病推荐食谱 | 40,221 | <鞘膜积液,推荐食谱,番茄冲菜牛肉丸汤>|
| has_symptom | 疾病症状 | 5,998 | <早期乳腺癌,疾病症状,乳腺组织肥厚>|
| acompany_with | 疾病并发疾病 | 12,029 | <下肢交通静脉瓣膜关闭不全,并发疾病,血栓闭塞性脉管炎>|
| Total | 总计 | 294,149 | 约30万关系量级|
1.3.4 知识图谱属性类型
| 属性类型 | 中文含义 | 举例 |
| :--- | :---: | :---: |
| name | 疾病名称 | 喘息样支气管炎 |
| desc | 疾病简介 | 又称哮喘性支气管炎... |
| cause | 疾病病因 | 常见的有合胞病毒等...|
| prevent | 预防措施 | 注意家族与患儿自身过敏史... |
| cure_lasttime | 治疗周期 | 6-12个月 |
| cure_way | 治疗方式 | "药物治疗","支持性治疗" |
| cured_prob | 治愈概率 | 95% |
| easy_get | 疾病易感人群 | 无特定的人群 |
# 二、基于医疗知识图谱的自动问答
# 2.1 技术架构
![image](https://github.com/liuhuanyong/QABasedOnMedicalKnowledgeGraph/blob/master/img/qa_route.png)
# 2.2 脚本结构
question_classifier.py:问句类型分类脚本
question_parser.py:问句解析脚本
chatbot_graph.py:问答程序脚本
# 2.3 支持问答类型
| 问句类型 | 中文含义 | 问句举例 |
| :--- | :---: | :---: |
| disease_symptom | 疾病症状| 乳腺癌的症状有哪些? |
| symptom_disease | 已知症状找可能疾病 | 最近老流鼻涕怎么办? |
| disease_cause | 疾病病因 | 为什么有的人会失眠?|
| disease_acompany | 疾病的并发症 | 失眠有哪些并发症? |
| disease_not_food | 疾病需要忌口的食物 | 失眠的人不要吃啥? |
| disease_do_food | 疾病建议吃什么食物 | 耳鸣了吃点啥? |
| food_not_disease | 什么病最好不要吃某事物 | 哪些人最好不好吃蜂蜜? |
| food_do_disease | 食物对什么病有好处| 鹅肉有什么好处? |
| disease_drug | 啥病要吃啥药 | 肝病要吃啥药? |
| drug_disease | 药品能治啥病 | 板蓝根颗粒能治啥病? |
| disease_check | 疾病需要做什么检查 | 脑膜炎怎么才能查出来?|
| check_disease | 检查能查什么病 | 全血细胞计数能查出啥来? |
| disease_prevent | 预防措施| 怎样才能预防肾虚? |
| disease_lasttime | 治疗周期 | 感冒要多久才能好? |
| disease_cureway | 治疗方式 | 高血压要怎么治? |
| disease_cureprob | 治愈概率 | 白血病能治好吗? |
| disease_easyget | 疾病易感人群 | 什么人容易得高血压? |
| disease_desc | 疾病描述 | 糖尿病 |
# 问答结果展示
用户:乳腺癌的症状有哪些?
小勇: 乳腺癌的症状包括:乳腺癌的远处转移;胸痛;乳头溢液;乳头破碎;肝肿大;泌乳障碍;乳头内陷;乳房肿块;剧痛
******************************************************************************************
用户:最近老流鼻涕怎么办?
小勇: 症状流鼻涕可能染上的疾病有:枯草热;副流行性感冒;急性上呼吸道感染;硫化氢中毒;小儿衣原体肺炎;风寒感冒;慢性额窦炎;鼻源性头痛;人禽流行性感冒;小儿流行性喘憋性肺炎;病毒性感冒;慢性鼻炎;风热犯肺;感冒;顿呛;小儿急性上呼吸道感染;嗜酸细胞增多性非变态反应性鼻炎;干酪性鼻窦炎;下呼吸道感染;麻疹
******************************************************************************************
用户:为什么有的人会失眠?
小勇: 失眠可能的成因有:躯体疾病和服用药物可以影响睡眠,如消化不良,头痛,背痛,关节炎,心脏病,糖尿病,哮喘,鼻窦炎,溃疡病,或服用某些影响中枢神经的药物。
由于生活方式引起睡眠问题也很常见,如饮用咖啡或茶叶,晚间饮酒,睡前进食或晚饭较晚造成满腹食物尚未消化,大量吸烟,睡前剧烈的体力活动,睡前过度的精神活动,夜班工作,白天小睡,上床时间不规律,起床时间不�
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Django项目之医疗知识图谱问答系统(源码+录像演示+文档).zip 【项目介绍】 高分通过项目,已获导师指导。 包含:项目源码、数据库脚本、LW、PPT、演示录像等,该项目可以直接作为毕设使用。 本项目主要针对计算机相关专业的正在做毕设的学生和需要项目实战练习的Python学习者。也可作为课程设计、期末大作业。 项目都经过严格调试,确保可以运行! 【项目功能】 本系统的主要模块如下: (1)前端界面模块:负责用户界面的设计和展示,包括前端页面、用户交互等。 (2)后台管理模块:负责系统的管理,包括用户管理、数据管理等。 (3)数据处理模块:负责系统的数据处理和存储,包括数据库设计和管理、知识图谱的构建和维护等。 (4)业务逻辑模块:负责系统的核心业务逻辑,包括问答系统的设计和实现、自然语言处理等。
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