序列；进化树

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序列；进化树

: 论文研究-基于H1N1型禽流感病毒的HA蛋白序列进化树研究.pdf 最后，利用基于模糊邻近关系的结构聚类方法进行H1N1型禽流感病毒HA蛋白质序列的进化树研究，将病毒分为33大类。进一步分析表明，H1N1病毒的变异不仅与爆发时间密切相关，还与所分布地域及地域间的距离有很大关系，即...
评级：0 浏览量：180 收藏量：0 资源大小：951KB 上传时间：2019-07-22

: MEGA6 进化树 基因蛋白序列进化分析
评级：0 浏览量：1789 收藏量：3 资源大小：39.44MB 上传时间：2017-07-27

: 系统进化树构建系统进化树的构建，下面介绍几个软件的使用。首先是PHYLIP。其是多个软件的压缩包，下载后双击则自动解压。当你解压后就挥发现PHYLIP的功能极其强大，主要包括五个方面的功能软件：i，DNA和蛋白质序列数据的分析软件...
评级：0 浏览量：1054 收藏量：2 资源大小：227KB 上传时间：2015-08-07

: 鸟类基因组进化树的构建与分析最后，通过将该树与Prum和Jarvis构建的进化树进行了比较，分析了鸟类的进化和分类. 结果发现三个进化树基本一致, 只有部分姐妹分支有差别, 说明12联体的相对频数是能够较好描述基因组进化的动力学变量。
评级：0 浏览量：365 收藏量：0 资源大小：1.31MB 上传时间：2021-03-07

: mega5进化树绘制遗传距离分析强大的分子生物学软件简单易上手好用该版本实用
评级：0 浏览量：3331 收藏量：0 资源大小：55.07MB 上传时间：2019-04-15

: Blast序列比对与利用mega构建进化树 具体介绍了如何在NCBI中进行Blast比对，然后利用下载的序列在mega中构建进化树，有许多图片作为范例
评级：0 浏览量：3196 收藏量：10 资源大小：493KB 上传时间：2015-04-08

: 一种基于Quartet Puzzling和邻接法的进化树构建算法它首先估计Quartet拓扑结构集合Q,然后利用重组技术将Q中的信息合并到一起构成一个包含所有序列的进化树.研究表明,QP的准确性不像人们所期望的那样高.如何快速有效地将Q所包含的信息融合在一起仍然是QP所面临的一个...
评级：0 浏览量：216 收藏量：0 资源大小：2.41MB 上传时间：2021-02-22

: MEGA6.06序列比对进化树分析软件.rar 软件介绍: MEGA6.06是分子生物学中应用研究中很基础的一个免费转件，安装后可支持fasta、txt的序列文件格式；主要功能是对核酸、蛋白质的序列比对、序列分析和进化树作图等分析计算；
评级：4 浏览量：2180 收藏量：1 资源大小：37.38MB 上传时间：2019-09-03

: 论文研究-一种新的关联特征和模糊聚类的进化树构建方法.pdf 利用三联体和单联核苷酸的联合概率分布的差异来表示序列之间的差异，提出了一种新的关联特征TBC；对TBC特征矩阵进行平移极差变换，利用指数切比雪夫距离...对两组基因组序列构建进化树，实验结果验证了该方法的有效性。
评级：0 浏览量：269 收藏量：1 资源大小：361KB 上传时间：2019-07-22

: 用新方法-H曲线构建DNA序列的系统进化树 本文通过以下方法展示了代表线粒体DNA序列的H曲线：压缩H曲线的距离，基于H曲线平均散度的距离以及基于H曲线两点之差的距离，以计算H曲线。八种线粒体DNA的距离矩阵，然后使用Kruskal算法构建DNA序列的系统进化树。
评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：251KB 上传时间：2021-03-10

: 16SrDNA序列对细菌进行系统发育树 16S rDNA序列分析法制作系统发育树
评级：0 浏览量：823 收藏量：2 资源大小：86KB 上传时间：2013-08-29

: 浅谈系统发育分析及进化树制作.ppt 系统发育分析是研究物种进化和系统分类的一种方法，研究对象为携带遗传信息的生物大分子序列，采用特定的数理统计算法来计算生物间的生物系统发生的关系。并用系统进化树来概括生物间的这种亲缘关系。
评级：0 浏览量：1973 收藏量：1 资源大小：3.18MB 上传时间：2020-02-03

: 生物序列比对而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测,物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。...
评级：0 浏览量：598 收藏量：0 资源大小：3.45MB 上传时间：2018-04-26

: 进化树绘制软件MEGA mega5.2 BioEdit 英文原版下载多重序列比对软件，掐头去尾，BioEdit 进化树绘制软件MEGA mega5.2 英文原版，原版附绘图详细过程！包会！先用标准株在BioEdit里面掐头去尾对齐序列，然后直接用mage分析出结果，一步搞定！
评级：0 浏览量：709 收藏量：1 资源大小：58.37MB 上传时间：2015-11-27

: 生物信息序列比对算法生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,...
评级：0 浏览量：855 收藏量：2 资源大小：1.97MB 上传时间：2018-04-27

: 基于进化树理论的甲型流感病毒血凝素同源性及进化分析* (2012年) 甲型流感病毒(influenza virus A)可以感染禽类，哺乳类等动物，威胁着人类健康．...利用Genbank的BLAST功能做同源性搜索，结合HA的进化树分析了我国甲型流感病毒株的现状，从而预测了潜在的甲型流感病
评级：0 浏览量：104 收藏量：0 资源大小：379KB 上传时间：2021-05-18

: 第二章核酸数据库及核酸序列的分析(第五构建进化树).ppt 第二章核酸数据库及核酸序列的分析(第五构建进化树)
评级：0 浏览量：41 收藏量：0 资源大小：2.62MB 上传时间：2022-06-12

: Geneious-windows * 进化树建设UPGMA，NJ bootstrapping和consensus trees * Contig assembly和色谱编辑 * 限制性内切酶分析 * PCR引物设计 * 蛋白质结构的观看 * 整合数据库-集成检索与GenBank，PubMed，BLAST和UniProt * 通过互联网...
评级：1 浏览量：935 收藏量：2 资源大小：44.34MB 上传时间：2014-04-15

: trevolver：使用三核苷酸环境在固定分支树上模拟不可逆DNA序列进化的程序 trevolver：使用三核苷酸环境在固定分支树上模拟不可逆DNA序列进化的程序
评级：0 浏览量：66 收藏量：0 资源大小：527KB 上传时间：2021-02-05

: 生物进化树中的模糊问题浅论 (2005年) 生物进化树是生物进化序列的特殊表现形式,它是生物进化论研究取得的重要成就,但生物进化树仍存在一些模糊问题。本文根据现代生物学、生物进化论、古生物学成就,就存在的模糊问题、产生原因及研究意义进行了浅简的...
评级：0 浏览量：38 收藏量：0 资源大小：3.33MB 上传时间：2021-05-19

: 基于归一化编辑距离的系统进化树重构 (2008年) 为了克服传统距离法在构建进化树时需要进行多序列比对所带来的计算复杂度问题，提出了利用两两序列之间的归一化编辑距离矩阵来构造进化树的方法。通过对11种脊椎动物和20种哺乳动物的Nd5、Nd4和cytb的基因序列以及...
评级：0 浏览量：62 收藏量：0 资源大小：272KB 上传时间：2021-05-14

: tskit：分析，创建和处理树序列 树序列格式由许多软件库和程序（例如，，和）输出，它们可以模拟或推断遗传序列的进化历史。 tskit库提供了用于加载，检查和操作树序列的基础功能，包括用于计算遗传统计数据的有效方法。它通常是其他软件包...
评级：0 浏览量：81 收藏量：0 资源大小：1.12MB 上传时间：2021-02-28

: 62个tRNA密码子序列的两种可能进化机制的比较在整个平行和反平行系统发育树的相同簇的密码子位点中发现了点突变，而在相应的反平行系统发育树中没有互补复制机制的证据。同源受体tRNA的密码子在邻近簇中发现或分布在很小的距离内，因此只有一个碱基差异的...
评级：0 浏览量：384 收藏量：0 资源大小：1.85MB 上传时间：2020-06-05

: MEGA-X-10.0.5 序列分析，进化树，生物信息学，生物学，医疗 Sophisticated and user-friendly software suite for analyzing DNA and protein sequence data from species and populations.
评级：0 浏览量：2779 收藏量：0 资源大小：92MB 上传时间：2018-12-25

: mega画系统发育树 16S基因片段组装，在NCBI中进行Blast比对，利用下载的序列在mega绘制进化树，多组图片作为详解！
评级：0 浏览量：586 收藏量：0 资源大小：15.53MB 上传时间：2018-05-17

: 组分矢量方法与小亚基核糖体RNA方法构建进化树的对比组分矢量方法与小亚基核糖体RNA方法构建进化树的对比，叶远浓，郭锋彪，生物进化研究是生物学的一个重要研究分支，随着生物技术发展和生物序列数据库数据的快速增长，出现了许多推断生物之间进化关系的
评级：0 浏览量：109 收藏量：0 资源大小：618KB 上传时间：2020-02-07

: 基于神经树的时间序列预测 (2007年) 采用语法引导的遗传编程来进化神经树的结构以建立一个时间序列预测模型,并把它和基于神经网络的时间序列预测模型的性能进行比较,结果显示本文提出的神经树时间序列预测模型较神经网络模型有更高的可信度。
评级：0 浏览量：16 收藏量：0 资源大小：448KB 上传时间：2021-05-11

: paml:PAML是使用DNA和蛋白质序列数据进行模型拟合和系统发育树重建的程序包最大似然法系统发育分析PAML 是一个使用 DNA 和蛋白质序列数据进行模型拟合和系统发育树重建的程序包。这些程序是用 ANSI C 编写的。
评级：0 浏览量：261 收藏量：1 资源大小：3.38MB 上传时间：2021-05-29

: 从细胞色素b基因序列分析羚牛分子系统进化 (2007年) 结合GenBank检索序列，对9种偶蹄类动物（麝牛、绵羊、羚牛等）、1种奇蹄类动物（斑马）的细胞色素b基因序列差异进行分析，并基于序列差异构建分子系统树。结果羚牛与羊亚科的动物亲缘关系最近（序列差异分别为9.085...
评级：0 浏览量：35 收藏量：0 资源大小：1.81MB 上传时间：2021-05-06

: 羊毛尾线虫线粒体rrnL基因部分序列的克隆和进化分析 (2013年) 为探明中国羊毛尾线虫（Trichuris ovis）广东分离株线粒体核糖体大亚基基因（rrnL）的部分序列（prrnL）的遗传变异情况，用prrnL序列构建其与其他毛尾线虫的进化关系；应用聚合酶链反应（PCR）扩增羊毛尾线虫虫株的 ...
评级：0 浏览量：86 收藏量：0 资源大小：279KB 上传时间：2021-06-14

: TBTV卫星RNA不同分离物的序列测定及系统进化分析 (2010年) 利用 RT-PCR方法对烟草丛顶...RNA的系统进化树。E结果显示: TBTV不同分离物卫星 RNA 的核苷酸同源性为79.2%～99.0%。它们与幽影病毒属其它成员卫星 RNA的核苷酸同源性为32.5%～ 44.1%。通过构建幽影病毒属成员卫星 RNA
评级：0 浏览量：49 收藏量：0 资源大小：740KB 上传时间：2021-05-10

: 基于18S rRNA基因序列的毛茛科及近缘植物的分子进化关系研究 (2010年) 基于18S rRNA基因序列以近缘植物Paeonia suf fruticosa 和 Mahonia bealei为...结果表明,18S rRNA基因序列长度范围在1807-1810bp之间,系统树显示耧斗菜属Aquilegia与唐松草属Thalic-trum,升麻属Cimici fuga与乌头属Acon
评级：0 浏览量：110 收藏量：0 资源大小：345KB 上传时间：2021-05-08

: TreeOfLife:生命之树生命之树基于现代分类学的生物进化树编辑程序。技术要点树与图的增删改查其及其序列化/反序列化文件封装与版本控制语义分析与模糊搜索树与图操作，搜索以及序列化/反序列化的性能优化版本跟踪里程碑10（开发中）即将...
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: beast2, 基于抽样树的贝叶斯进化分析.zip beast2, 基于抽样树的贝叶斯进化分析 Beast 2 Beast 是一种基于分子序列MCMC的贝叶斯推理交叉平台程序。它完全向根的方向推导，时间测量phylogenies使用严格或者松松的分子时钟模型推断出来。它可以以作为一种重构...
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: 梅花鹿骨形态发生蛋白BMP4基因的克隆与序列分析 (2012年) 通过提取梅花鹿肝脏总RNA以及采用RT-PCR技术，成功克隆梅花鹿骨形态发生蛋白BMP4基因序列，并对其核酸序列、蛋白质序列，功能保守区、亲疏水性进行生物信息学分析，同时构建序列进化树以及部分结构的三维模型．...
评级：0 浏览量：52 收藏量：0 资源大小：413KB 上传时间：2021-06-12

: 建昌鸭线粒体基因组全序列分析 (2010年) 参照近源物种线粒体基因组序列设计引物15对,用PCR产物直接测序法测得建昌鸭(Anasplatyrhychos)线粒体基因组全序列,初步分析其特点和各...基于线粒体13个蛋白质编码基因序列,采用邻接法构建雁形目8个物种的系统进化树,
评级：0 浏览量：105 收藏量：0 资源大小：227KB 上传时间：2021-05-15

: physcraper:基因树更新使用树和单个基因座比对来查找和添加同源序列，以改善和推进群体中的系统发育推断。正在积极开发该工具。如果您需要任何帮助或有反馈，请发布GitHub问题或联系。这是代码库。有关使用Anaconda或Virtualenv ...
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: 中缅树鼩NPY、POMC和CART基因部分序列扩增与分析中缅树鼩NPY、POMC和CART基因部分序列扩增与分析，张浩，杨盛昌，NPY、POMC和CART是下丘脑调节能量稳态的重要神经肽，在进化中非常保守，能准确反映远缘物种间的亲缘关系。本研究通过RT-PCR扩增中缅树�
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: SNPhylo:根据巨大的SNP数据生成系统树的管道系统发育树是推断各种生物之间进化关系的良好工具，因此该树已在许多进化研究中使用。因此，在重新测序项目中已经确定了基于SNP数据的系统树。但是，没有简单的方法来确定具有大量从重测序数据中确定的变异体的...
评级：0 浏览量：705 收藏量：0 资源大小：23.2MB 上传时间：2021-05-06

: 论文研究 - 铁蛋白亚基数目与外径大小关系的数值研究为了改进模型，我们通过分子进化将25种蛋白质分为两组，然后建立线性模型。一组的相关系数为R2 = 0.98。基于计算和建模，我们假设3kx9定点诱变形成的新铁蛋白不再是24链突变，而是36链突变。
评级：0 浏览量：93 收藏量：0 资源大小：608KB 上传时间：2020-05-25

: metablastr:使用R进行大规模BLAST序列搜索现在可以使用R包自动访问和检索此数据，下一步是利用大量的序列多样性来探索和检测可进化性，变异性和疾病出现的新颖模式。 R包解决了以标准化和计算可重现的方式检索大量生物序列数据的问题，而metablastr包旨在...
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: clustal多序列比对汉化版一个很不错的DNA序列分析软件，集序列比对、进化树构建于一身。
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: 中国芒叶绿体DNA trnL-F序列变异及遗传结构分析中国芒叶绿体DNA trnL-F序列变异及遗传结构分析，严海东，张新全，中国芒（Miscanthus sinensis）是重要的能源植物之一，同时在干扰的生境中也是一种重要的先锋植物。为了明确中国西南区中国芒群体的叶�
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: 发育树构建6 用以编辑序列数据、序列比对、构建系统发育树，推测物种间进化距离
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: 兔疥螨副肌球蛋白基因的RT-PCR扩增克隆与序列分析 (2009年) 在首次建立兔疥螨人工感染增殖以及分离纯化方法的基础上,参考Gene Bank中登录的红狐疥螨副肌球蛋白基因序列(AF462195)以及人疥螨副肌球蛋白部分...进化树分析可知,3者在亲缘关系上极为相近,而兔疥螨与人疥螨则更为接近.
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: museqa：使用混合并行计算的多序列比对器这使生物学家能够了解许多不同物种之间的进化关系。但是，对该问题的最佳解决方案在计算上是困难的，即，如果序列的数量或此类序列的大小任意大，则不能及时执行。作为替代方案，已经出现了几种方法作为对该问题...
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: 基于l6S rRNA和POMC基因序列的中国北方林蛙属动物系统发生关系 (2012年) 利用MP法、ML法和BI法构建系统进化树，结果显示林蛙属物种构成单系群，其中东北种群聚为一支，中国林蛙聚为一支，支持东北林蛙为有效物种．桓仁林蛙和核型为2n=26的林蛙属物种聚为一支，因此不支持核型为2n=24的林蛙...
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: 基于ITS序列分析的工厂化生产金针菇菌种鉴定 (2012年) 对从山东省邹城市采集的6个工厂化生产金针菇菌株分别进行ITS序列测序,并进行序列比对和进化树的构建。结果表明,6个菌株的ITS序列中存在1个或以上碱基差异的位点共有52个;其ITS序列具有高度相似性的同时具有一定差异;...
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