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DNA序列动态规划法比对的C代码
DNA序列动态规划法比对的C代码
序列比对
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2014-12-29
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DNA序列动态规划法比对的C代码,生物信息学的内容,动态规划法
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动态规划算法的c++实现 能实现两序列的比对
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动态规划算法的vc++6.0 实现 能实现两蛋白质序列的比对.
js DNA动态序列比对代码
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JavaScript动态序列比对代码,随便 写着玩的,在网上见到用VC、VB写的比较多,这个算法以前在高中课本上见到过,我只是用Js写一下试试,或许还不是太准确。
alignTools.C:序列比对(C)的实现
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alignTools alignTools是用于逐对DNA序列比对的C实现工具的集合。 它包括以下对齐功能: 整体一致性 局部语言 适合对齐(跳跃状态) 重叠对齐 编辑距离 不久的将来将添加更多功能。 版本 0.7.23-r15 开始使用 安装 $ git clone git@github.com:r3fang/alignTools.git $ cd alignTools $ make
比较强大的序列比对(C++)
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是利用快速检索算法开发的超快的序列比对软件,有参考价值
动态编程和基因序列比对
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基因组数据库保存了海量的原始数据。人类基因本身就有接近 30 亿个 DNA 碱基对。为了查遍所有数据并找到其中有意义的关系,分子生物学家们越来越依赖于高效的计算机科学字符串算法。本文将介绍三个这方面的算法,它们都利用动态编程 技术,这是解决最优化问题的一种高级的算法技术,它从下向上寻找子问题的最优解。本文将使用这些算法的 Java™ 实现,还将学习一个用于处理生物学数据的开源的 Java 框架。
基因序列比对
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通过编程实现课程中介绍的全局比对和局部比对的动态规划算法,并对“data.txt”中的2 条序列(每行代表1 条序列)进行测试,打分矩阵使用BLOSUM62 矩阵(BLOSUM62.txt)。
序列比对算法使用动态规划化方法实现序列比对算法
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使用动态规划化方法实现序列比对算法,有详细注解
人类基因相似度对比ACTG
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jva语言开发的案例:人类基因由4种核苷酸,分别用字母ACTG表示。要求编写一个程序,按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度。即两给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG,它们有多相似呢?测量两个基因的相似度一种方法称为对齐。使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格,让两个基因的长度相等,然后根据基因的分值矩阵计算分数。
seq-align:Needleman-Wunsch和Smith-Waterman序列比对的快速,便携式C实现
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序列对齐 C语言中的Smith-Waterman和Needleman-Wunsch对齐网址: : 作者:艾萨克·特纳(Isaac Turner) 许可证:公共领域更新时间:2015年8月18日 关于 最佳局部(Smith-Waterman)和全局(Needleman-Wunsch)对齐算法的C实现。 编写为快速,便携式和易于使用。 命令行实用程序smith_waterman和needlema
动态规划和序列对比
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动态规划是序列分析中常用的一种算法技术。动态规划是用来当递归可以使用但会效率低下,因为它会重复解决相同的问题。例如,考虑斐波那契数列:0,1,1,2,3,5,8,13,…第一个和第二个Fibonacci数被定义为0和1,分别。第n个Fibonacci数定义为前两个Fibonacci数的总和。因此,您可以使用递归函数计算第n个斐波那契数 同源性是一个重要的生物学概念。两个物种被认为是同源的,如果他们
DNA序列翻译为氨基酸
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perl 代码写的 DNA序列比对,用的是smith比对的算法,只要提交输入比较比对即可
DNA序列转换把DNA序列倒转
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这是一个可以把DNA序列进行倒转的小软件.输入一个序列,输出序列的倒转.里面有源代码,有DEBUG版本,有RELEASE版本.谢谢支持.
sequencher DNA序列比对分析软件
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一款DNA序列比对的软件,可用于DNA序列的分析、比对,酶切位点的查找等。
生物DNA序列比对算法研究
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生物DNA序列比对算法研究!!!生物DNA序列比对算法研究!!!生物DNA序列比对算法研究!!!
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类基因由4种核苷酸 分别用字母ACTG表示 要求编写一个程序 按以下规划比较两个基因序列并确定它们的相似程度 即两 给出两个基因序列AGTGATG和GTTAG 它们有多相似呢 测量两个基因的相似度一种方法称为对齐 使用对齐方法可以在基因的适当位置加入空格 让两个基因的长度相等 然后根据基因的分值矩阵计算分数 A C G T A 5 1 2 1 3 C 1 5 3 2 4 G
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阿光365
2015-05-08
相当不错,继续努力学习
清宁
2015-01-13
还可以,有一定参考价值
Marvinsky
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