邓飞—DMU 遗传参数 cookbook
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目录
1. DMU 参数介绍 ............................................................................................................................................2
DMU 软件介绍 ............................................................................................................................................2
学习 DMU 初衷 ...........................................................................................................................................3
DMU 语法介绍 ............................................................................................................................................4
文件输出 .......................................................................................................................................................6
命令行文件执行 ..........................................................................................................................................6
2. DMU-单性状动物模型 .............................................................................................................................7
单性状动物模型 ..........................................................................................................................................7
需要做的处理 .....................................................................................................................................8
文件类型 ..............................................................................................................................................9
执行 DIR 文件 ........................................................................................................................................... 12
查看结果 .................................................................................................................................................... 12
对比 asreml 的结果: ............................................................................................................................... 14
DMU 和 asreml 比较 .............................................................................................................................. 14
3. DMU-单性状重复力模型 ..................................................................................................................... 15
单性状重复力模型 .................................................................................................................................. 15
需要做的处理 .................................................................................................................................. 16
执行 DIR 文件 ........................................................................................................................................... 20
查看结果 .................................................................................................................................................... 20
对比 asreml 的结果: ............................................................................................................................... 22
DMU 和 asreml 比较 .............................................................................................................................. 23
4. DMU-多性状动物模型 .......................................................................................................................... 24
多性状动物模型 ....................................................................................................................................... 24
需要做的处理 .................................................................................................................................. 25
执行 DIR 文件 ........................................................................................................................................... 28
查看结果 .................................................................................................................................................... 29
对比 asreml 的结果: ............................................................................................................................... 30
DMU 和 asreml 比较 .............................................................................................................................. 31
5. DMU-单性状母体模型 .......................................................................................................................... 32
单性状动物模型-母体效应 .................................................................................................................. 32
需要做的处理 .................................................................................................................................. 33
执行 DIR 文件 ........................................................................................................................................... 36
查看结果 .................................................................................................................................................... 36
对比 asreml 的结果: ............................................................................................................................... 38
DMU 和 asreml 比较 .............................................................................................................................. 38
6. DMU-Linux 下 vim 语法高亮设置 ..................................................................................................... 39
设置的效果如下 ....................................................................................................................................... 39
设置流程 .................................................................................................................................................... 39
DIR.vim 文件: ............................................................................................................................................ 40
DIR_suffix.vim 文件: ................................................................................................................................ 40
测试 .............................................................................................................................................................. 41
7. 参考资料: ................................................................................................................................................... 42
