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链特异性RT-qPCR标准曲线制备
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2022-05-31
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链特异性RT-qPCR标准曲线制备
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qPCR 标准曲线制
实验注意事项
1. 试剂耗材准备: qPCR 的操作简单但是要严谨!建议小伙伴们提前备好耗材和
试剂!耗材保证无酶无菌,个人建议尽量选择进口枪头,减少液体挂壁,更
为准确。(使用过很多厂家的八连管,进口的不管是做工还是结果上, 本人都觉得更好,
也欢迎小伙伴们好货推荐! )镊子提前高压,加样所用金属托架提前放置冰箱降
温。
2. RNA 提取和反转录:低温操作! Trizol 提取时注意蛋白质层的分离! Mix 配置后
切忌不可反复冻融!注意空气中片段核酸污染! RNA 提取后不可久放尽快反转
录!
3. 体系配制:注意避光!首先口罩戴起,头发扎好;每个样品设置 3 个平行孔,保
证数据真实可用;反转录时可能同一样本核酸有多个小 EP 管分装,建议配体系
时尽量转移- -个管中匀后加样,保证平行孔间数据稳定;没有排枪的小伙伴们
加样只要手法稳定也是能保证结果的。(建议新手们提前在实验记录本上规划好加
样安排,操作时不易出错,整理数据时也清晰明了。)
4. 上机操作:上机前首先离心, 如果管内有"顽固”气泡可以用手指轻轻弹就能
完美解决!加完的样本不能久置,须立刻上机。
实验步骤:
1. 提取样品总 RNA(按试剂盒步骤操作)
2. 采用 super RT cDNA Synthesis Kit (CW. BIO) 反转录试剂盒,其中链特异性引
物(T-CBPVR、T-CBPVF、T-ABPVF、T-ABPVR)取代 Primer Mix,其余试剂按照
试剂盒步骤操作,42 42 min, 85 5 min℃ ℃ 。(注:此时的 cDNA 为双链,一条
链为病毒 RNA,一条为特异性引物合成的 DNA,结构稳定)
3. 在上述合成的 cDNA(20 ul 溶液)加入 0.4 ul RNase A(10mg/ml), 37 60℃
min。-20℃保存。(注:加入 RNaseA 处理后,此时的 cDNA 为单链,不稳定,需
及时做后续实验)
4. 使用不含标签 qPCR 引物和标签引物( CBPVF Tag; CBPVR Tag; ABPVR Tag;
CBPVF Tag),PCR 体系 20ul:2×Tag mix 10 ul、ddH
2
O 7ul、引物各 1ul、模板
1ul,短暂离心。
5. PCR 设置程序:94 ℃ 预变性 2 min, 94℃变性 30 S,55℃退火 30 S,72℃延
伸 30 S,25 个循环,继续 72℃延伸 5min。
6. 观察条带大小及引物特异性,若引物特异性不好,重新筛选引物;
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江南素雪
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